Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xbp1O35426 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xbp1O35426 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xbp1O35426 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xbp1O35426 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xbp1O35426 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xbp1O35426 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xbp1O35426 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xbp1O35426 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xbp1O35426 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xbp1O35426 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xbp1O35426 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xbp1O35426 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Xbp1O35426 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Xbp1O35426 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Xbp1O35426 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xbp1O35426 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xbp1O35426 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xbp1O35426 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Xbp1O35426 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Xbp1O35426 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xbp1O35426 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xbp1O35426 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xbp1O35426 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xbp1O35426 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xbp1O35426 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xbp1O35426 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xbp1O35426 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xbp1O35426 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xbp1O35426 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xbp1O35426 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xbp1O35426 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xbp1O35426 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xbp1O35426 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xbp1O35426 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xbp1O35426 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Xbp1O35426 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xbp1O35426 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xbp1O35426 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Xbp1O35426 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Xbp1O35426 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Xbp1O35426 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Xbp1O35426 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Xbp1O35426 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xbp1O35426 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xbp1O35426 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xbp1O35426 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xbp1O35426 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Xbp1O35426 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xbp1O35426 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Xbp1O35426 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xbp1O35426 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Xbp1O35426 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Xbp1O35426 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Xbp1O35426 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms