Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Abcc1O35379 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Abcc1O35379 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Abcc1O35379 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Abcc1O35379 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Abcc1O35379 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Abcc1O35379 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Abcc1O35379 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Abcc1O35379 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Abcc1O35379 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Abcc1O35379 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Abcc1O35379 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Abcc1O35379 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Abcc1O35379 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Abcc1O35379 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
Abcc1O35379 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Abcc1O35379 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Abcc1O35379 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Abcc1O35379 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
Abcc1O35379 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Abcc1O35379 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Abcc1O35379 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Abcc1O35379 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Abcc1O35379 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Abcc1O35379 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Abcc1O35379 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Abcc1O35379 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
Abcc1O35379 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Abcc1O35379 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.22
Abcc1O35379 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Abcc1O35379 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Abcc1O35379 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Abcc1O35379 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Abcc1O35379 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Abcc1O35379 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Abcc1O35379 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Abcc1O35379 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Abcc1O35379 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Abcc1O35379 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Abcc1O35379 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
Abcc1O35379 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Abcc1O35379 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Abcc1O35379 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Abcc1O35379 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Abcc1O35379 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Abcc1O35379 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Abcc1O35379 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Abcc1O35379 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Abcc1O35379 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Abcc1O35379 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Abcc1O35379 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Abcc1O35379 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Abcc1O35379 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Abcc1O35379 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Abcc1O35379 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Abcc1O35379 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Abcc1O35379 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Abcc1O35379 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Abcc1O35379 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
Abcc1O35379 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Abcc1O35379 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Abcc1O35379 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Abcc1O35379 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
Abcc1O35379 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Abcc1O35379 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Abcc1O35379 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Abcc1O35379 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Abcc1O35379 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Abcc1O35379 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Abcc1O35379 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Abcc1O35379 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Abcc1O35379 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Abcc1O35379 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Abcc1O35379 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Abcc1O35379 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Abcc1O35379 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
Abcc1O35379 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Abcc1O35379 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Abcc1O35379 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Abcc1O35379 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Abcc1O35379 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Abcc1O35379 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Abcc1O35379 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Abcc1O35379 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
Abcc1O35379 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Abcc1O35379 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Abcc1O35379 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Abcc1O35379 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
Abcc1O35379 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Abcc1O35379 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Abcc1O35379 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Abcc1O35379 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Abcc1O35379 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Abcc1O35379 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Abcc1O35379 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Abcc1O35379 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Abcc1O35379 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Abcc1O35379 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Abcc1O35379 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Abcc1O35379 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms