Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dgcr6O35347 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dgcr6O35347 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dgcr6O35347 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dgcr6O35347 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dgcr6O35347 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dgcr6O35347 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dgcr6O35347 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dgcr6O35347 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Dgcr6O35347 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dgcr6O35347 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dgcr6O35347 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dgcr6O35347 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dgcr6O35347 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dgcr6O35347 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dgcr6O35347 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dgcr6O35347 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dgcr6O35347 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dgcr6O35347 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dgcr6O35347 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dgcr6O35347 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dgcr6O35347 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dgcr6O35347 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dgcr6O35347 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dgcr6O35347 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dgcr6O35347 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dgcr6O35347 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dgcr6O35347 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dgcr6O35347 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dgcr6O35347 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dgcr6O35347 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dgcr6O35347 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dgcr6O35347 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dgcr6O35347 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Dgcr6O35347 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Dgcr6O35347 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dgcr6O35347 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Dgcr6O35347 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dgcr6O35347 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dgcr6O35347 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dgcr6O35347 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dgcr6O35347 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dgcr6O35347 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dgcr6O35347 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dgcr6O35347 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dgcr6O35347 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dgcr6O35347 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dgcr6O35347 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dgcr6O35347 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dgcr6O35347 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dgcr6O35347 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dgcr6O35347 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dgcr6O35347 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dgcr6O35347 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dgcr6O35347 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dgcr6O35347 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dgcr6O35347 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dgcr6O35347 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dgcr6O35347 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dgcr6O35347 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Dgcr6O35347 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dgcr6O35347 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dgcr6O35347 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dgcr6O35347 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dgcr6O35347 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Dgcr6O35347 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Dgcr6O35347 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dgcr6O35347 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dgcr6O35347 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dgcr6O35347 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dgcr6O35347 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dgcr6O35347 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dgcr6O35347 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dgcr6O35347 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dgcr6O35347 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dgcr6O35347 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dgcr6O35347 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dgcr6O35347 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Dgcr6O35347 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Dgcr6O35347 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dgcr6O35347 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dgcr6O35347 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dgcr6O35347 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dgcr6O35347 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dgcr6O35347 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dgcr6O35347 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dgcr6O35347 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dgcr6O35347 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dgcr6O35347 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Dgcr6O35347 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Dgcr6O35347 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dgcr6O35347 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dgcr6O35347 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Dgcr6O35347 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dgcr6O35347 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dgcr6O35347 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Dgcr6O35347 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dgcr6O35347 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dgcr6O35347 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dgcr6O35347 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.3 ms