Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pitx3O35160 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pitx3O35160 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pitx3O35160 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pitx3O35160 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pitx3O35160 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pitx3O35160 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pitx3O35160 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pitx3O35160 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pitx3O35160 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pitx3O35160 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pitx3O35160 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pitx3O35160 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pitx3O35160 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pitx3O35160 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pitx3O35160 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pitx3O35160 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pitx3O35160 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pitx3O35160 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pitx3O35160 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pitx3O35160 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pitx3O35160 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pitx3O35160 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pitx3O35160 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pitx3O35160 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pitx3O35160 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pitx3O35160 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pitx3O35160 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pitx3O35160 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pitx3O35160 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pitx3O35160 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pitx3O35160 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pitx3O35160 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pitx3O35160 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pitx3O35160 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pitx3O35160 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pitx3O35160 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pitx3O35160 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pitx3O35160 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pitx3O35160 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pitx3O35160 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pitx3O35160 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pitx3O35160 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pitx3O35160 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pitx3O35160 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pitx3O35160 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pitx3O35160 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pitx3O35160 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pitx3O35160 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pitx3O35160 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pitx3O35160 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pitx3O35160 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pitx3O35160 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pitx3O35160 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pitx3O35160 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pitx3O35160 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pitx3O35160 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pitx3O35160 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pitx3O35160 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pitx3O35160 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Pitx3O35160 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pitx3O35160 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pitx3O35160 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pitx3O35160 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pitx3O35160 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pitx3O35160 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pitx3O35160 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pitx3O35160 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pitx3O35160 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pitx3O35160 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pitx3O35160 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pitx3O35160 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pitx3O35160 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pitx3O35160 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pitx3O35160 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pitx3O35160 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pitx3O35160 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pitx3O35160 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pitx3O35160 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pitx3O35160 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pitx3O35160 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pitx3O35160 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pitx3O35160 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pitx3O35160 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pitx3O35160 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pitx3O35160 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pitx3O35160 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pitx3O35160 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pitx3O35160 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pitx3O35160 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pitx3O35160 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pitx3O35160 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pitx3O35160 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pitx3O35160 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pitx3O35160 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pitx3O35160 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pitx3O35160 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pitx3O35160 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pitx3O35160 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pitx3O35160 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms