Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Polr1aO35134 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Polr1aO35134 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Polr1aO35134 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Polr1aO35134 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Polr1aO35134 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Polr1aO35134 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Polr1aO35134 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Polr1aO35134 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Polr1aO35134 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Polr1aO35134 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Polr1aO35134 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Polr1aO35134 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Polr1aO35134 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Polr1aO35134 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Polr1aO35134 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Polr1aO35134 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Polr1aO35134 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Polr1aO35134 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Polr1aO35134 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Polr1aO35134 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Polr1aO35134 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Polr1aO35134 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Polr1aO35134 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Polr1aO35134 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Polr1aO35134 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Polr1aO35134 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Polr1aO35134 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Polr1aO35134 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Polr1aO35134 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Polr1aO35134 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Polr1aO35134 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Polr1aO35134 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
Polr1aO35134 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Polr1aO35134 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Polr1aO35134 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Polr1aO35134 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Polr1aO35134 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Polr1aO35134 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Polr1aO35134 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
Polr1aO35134 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Polr1aO35134 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Polr1aO35134 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Polr1aO35134 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Polr1aO35134 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Polr1aO35134 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Polr1aO35134 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Polr1aO35134 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Polr1aO35134 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Polr1aO35134 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Polr1aO35134 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Polr1aO35134 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Polr1aO35134 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Polr1aO35134 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Polr1aO35134 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Polr1aO35134 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Polr1aO35134 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Polr1aO35134 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Polr1aO35134 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Polr1aO35134 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
Polr1aO35134 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Polr1aO35134 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Polr1aO35134 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Polr1aO35134 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Polr1aO35134 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Polr1aO35134 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Polr1aO35134 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Polr1aO35134 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Polr1aO35134 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Polr1aO35134 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Polr1aO35134 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Polr1aO35134 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Polr1aO35134 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Polr1aO35134 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
Polr1aO35134 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Polr1aO35134 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Polr1aO35134 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Polr1aO35134 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Polr1aO35134 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Polr1aO35134 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Polr1aO35134 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.18
Polr1aO35134 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Polr1aO35134 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Polr1aO35134 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Polr1aO35134 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Polr1aO35134 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Polr1aO35134 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Polr1aO35134 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Polr1aO35134 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Polr1aO35134 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Polr1aO35134 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Polr1aO35134 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Polr1aO35134 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Polr1aO35134 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Polr1aO35134 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Polr1aO35134 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Polr1aO35134 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Polr1aO35134 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Polr1aO35134 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Polr1aO35134 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.4 ms