Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Casq1O09165 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Casq1O09165 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Casq1O09165 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Casq1O09165 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Casq1O09165 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Casq1O09165 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Casq1O09165 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Casq1O09165 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Casq1O09165 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Casq1O09165 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Casq1O09165 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Casq1O09165 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Casq1O09165 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Casq1O09165 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Casq1O09165 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Casq1O09165 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Casq1O09165 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Casq1O09165 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Casq1O09165 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Casq1O09165 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Casq1O09165 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Casq1O09165 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Casq1O09165 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Casq1O09165 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Casq1O09165 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Casq1O09165 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Casq1O09165 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Casq1O09165 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Casq1O09165 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Casq1O09165 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Casq1O09165 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Casq1O09165 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Casq1O09165 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Casq1O09165 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Casq1O09165 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Casq1O09165 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Casq1O09165 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Casq1O09165 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Casq1O09165 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Casq1O09165 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Casq1O09165 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Casq1O09165 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Casq1O09165 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Casq1O09165 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Casq1O09165 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Casq1O09165 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Casq1O09165 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Casq1O09165 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Casq1O09165 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Casq1O09165 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Casq1O09165 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Casq1O09165 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Casq1O09165 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Casq1O09165 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Casq1O09165 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Casq1O09165 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Casq1O09165 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Casq1O09165 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Casq1O09165 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Casq1O09165 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Casq1O09165 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Casq1O09165 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Casq1O09165 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Casq1O09165 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Casq1O09165 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Casq1O09165 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Casq1O09165 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Casq1O09165 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Casq1O09165 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Casq1O09165 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Casq1O09165 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Casq1O09165 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Casq1O09165 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Casq1O09165 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Casq1O09165 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Casq1O09165 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Casq1O09165 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Casq1O09165 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Casq1O09165 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Casq1O09165 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Casq1O09165 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Casq1O09165 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Casq1O09165 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Casq1O09165 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Casq1O09165 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Casq1O09165 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Casq1O09165 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Casq1O09165 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Casq1O09165 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Casq1O09165 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Casq1O09165 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Casq1O09165 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Casq1O09165 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Casq1O09165 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Casq1O09165 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Casq1O09165 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Casq1O09165 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Casq1O09165 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Casq1O09165 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
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