Protein–RNA interactions for Protein: O09116

Sprr3, Small proline-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr3O09116 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sprr3O09116 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sprr3O09116 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sprr3O09116 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sprr3O09116 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sprr3O09116 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sprr3O09116 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sprr3O09116 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sprr3O09116 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sprr3O09116 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sprr3O09116 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sprr3O09116 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sprr3O09116 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sprr3O09116 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sprr3O09116 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sprr3O09116 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sprr3O09116 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sprr3O09116 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sprr3O09116 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sprr3O09116 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sprr3O09116 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sprr3O09116 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sprr3O09116 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sprr3O09116 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sprr3O09116 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sprr3O09116 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sprr3O09116 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sprr3O09116 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sprr3O09116 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sprr3O09116 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sprr3O09116 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sprr3O09116 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sprr3O09116 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sprr3O09116 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sprr3O09116 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sprr3O09116 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sprr3O09116 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sprr3O09116 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sprr3O09116 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sprr3O09116 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sprr3O09116 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sprr3O09116 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sprr3O09116 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sprr3O09116 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sprr3O09116 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sprr3O09116 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sprr3O09116 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sprr3O09116 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sprr3O09116 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sprr3O09116 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sprr3O09116 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sprr3O09116 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sprr3O09116 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sprr3O09116 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sprr3O09116 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sprr3O09116 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sprr3O09116 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sprr3O09116 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sprr3O09116 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sprr3O09116 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sprr3O09116 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sprr3O09116 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sprr3O09116 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sprr3O09116 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sprr3O09116 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sprr3O09116 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sprr3O09116 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sprr3O09116 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sprr3O09116 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sprr3O09116 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sprr3O09116 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sprr3O09116 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sprr3O09116 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sprr3O09116 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sprr3O09116 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sprr3O09116 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sprr3O09116 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sprr3O09116 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sprr3O09116 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sprr3O09116 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sprr3O09116 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sprr3O09116 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sprr3O09116 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sprr3O09116 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sprr3O09116 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sprr3O09116 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sprr3O09116 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sprr3O09116 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sprr3O09116 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sprr3O09116 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sprr3O09116 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sprr3O09116 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sprr3O09116 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sprr3O09116 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sprr3O09116 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sprr3O09116 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sprr3O09116 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sprr3O09116 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sprr3O09116 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sprr3O09116 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms