Protein–RNA interactions for Protein: O08790

Fpr-s1, Formyl peptide receptor-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fpr-s1O08790 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fpr-s1O08790 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fpr-s1O08790 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fpr-s1O08790 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fpr-s1O08790 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fpr-s1O08790 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fpr-s1O08790 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fpr-s1O08790 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fpr-s1O08790 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fpr-s1O08790 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fpr-s1O08790 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fpr-s1O08790 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fpr-s1O08790 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fpr-s1O08790 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fpr-s1O08790 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fpr-s1O08790 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fpr-s1O08790 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fpr-s1O08790 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fpr-s1O08790 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fpr-s1O08790 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fpr-s1O08790 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fpr-s1O08790 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Fpr-s1O08790 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Fpr-s1O08790 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Fpr-s1O08790 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fpr-s1O08790 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fpr-s1O08790 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fpr-s1O08790 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fpr-s1O08790 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fpr-s1O08790 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fpr-s1O08790 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fpr-s1O08790 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fpr-s1O08790 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fpr-s1O08790 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Fpr-s1O08790 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fpr-s1O08790 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fpr-s1O08790 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fpr-s1O08790 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fpr-s1O08790 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fpr-s1O08790 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fpr-s1O08790 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fpr-s1O08790 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fpr-s1O08790 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fpr-s1O08790 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fpr-s1O08790 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Fpr-s1O08790 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fpr-s1O08790 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fpr-s1O08790 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fpr-s1O08790 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Fpr-s1O08790 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fpr-s1O08790 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fpr-s1O08790 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fpr-s1O08790 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fpr-s1O08790 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fpr-s1O08790 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fpr-s1O08790 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fpr-s1O08790 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fpr-s1O08790 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fpr-s1O08790 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fpr-s1O08790 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fpr-s1O08790 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fpr-s1O08790 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fpr-s1O08790 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fpr-s1O08790 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fpr-s1O08790 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fpr-s1O08790 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fpr-s1O08790 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fpr-s1O08790 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fpr-s1O08790 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fpr-s1O08790 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Fpr-s1O08790 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fpr-s1O08790 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fpr-s1O08790 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fpr-s1O08790 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fpr-s1O08790 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fpr-s1O08790 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fpr-s1O08790 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fpr-s1O08790 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fpr-s1O08790 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fpr-s1O08790 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fpr-s1O08790 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fpr-s1O08790 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fpr-s1O08790 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fpr-s1O08790 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fpr-s1O08790 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fpr-s1O08790 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fpr-s1O08790 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fpr-s1O08790 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fpr-s1O08790 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fpr-s1O08790 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fpr-s1O08790 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fpr-s1O08790 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fpr-s1O08790 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fpr-s1O08790 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fpr-s1O08790 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fpr-s1O08790 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fpr-s1O08790 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fpr-s1O08790 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fpr-s1O08790 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fpr-s1O08790 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms