Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
U90926O08546 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
U90926O08546 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
U90926O08546 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
U90926O08546 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
U90926O08546 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
U90926O08546 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
U90926O08546 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
U90926O08546 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
U90926O08546 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
U90926O08546 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
U90926O08546 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
U90926O08546 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
U90926O08546 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
U90926O08546 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
U90926O08546 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
U90926O08546 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
U90926O08546 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
U90926O08546 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
U90926O08546 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
U90926O08546 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
U90926O08546 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
U90926O08546 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
U90926O08546 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
U90926O08546 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
U90926O08546 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
U90926O08546 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
U90926O08546 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
U90926O08546 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
U90926O08546 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
U90926O08546 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
U90926O08546 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
U90926O08546 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
U90926O08546 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
U90926O08546 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
U90926O08546 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
U90926O08546 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
U90926O08546 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
U90926O08546 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
U90926O08546 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
U90926O08546 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
U90926O08546 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
U90926O08546 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
U90926O08546 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
U90926O08546 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
U90926O08546 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
U90926O08546 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
U90926O08546 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
U90926O08546 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
U90926O08546 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
U90926O08546 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
U90926O08546 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
U90926O08546 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
U90926O08546 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
U90926O08546 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
U90926O08546 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
U90926O08546 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
U90926O08546 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
U90926O08546 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
U90926O08546 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
U90926O08546 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
U90926O08546 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
U90926O08546 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
U90926O08546 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
U90926O08546 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
U90926O08546 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
U90926O08546 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
U90926O08546 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
U90926O08546 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
U90926O08546 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
U90926O08546 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
U90926O08546 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
U90926O08546 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
U90926O08546 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
U90926O08546 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
U90926O08546 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
U90926O08546 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
U90926O08546 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
U90926O08546 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
U90926O08546 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
U90926O08546 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
U90926O08546 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
U90926O08546 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
U90926O08546 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
U90926O08546 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
U90926O08546 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
U90926O08546 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
U90926O08546 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
U90926O08546 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
U90926O08546 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
U90926O08546 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
U90926O08546 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
U90926O08546 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
U90926O08546 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
U90926O08546 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
U90926O08546 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
U90926O08546 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
U90926O08546 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
U90926O08546 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
U90926O08546 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms