Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ27

Ccdc191, Coiled-coil domain-containing 191, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc191J3QQ27 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc191J3QQ27 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc191J3QQ27 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc191J3QQ27 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc191J3QQ27 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc191J3QQ27 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc191J3QQ27 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc191J3QQ27 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc191J3QQ27 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc191J3QQ27 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc191J3QQ27 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc191J3QQ27 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc191J3QQ27 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc191J3QQ27 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc191J3QQ27 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc191J3QQ27 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc191J3QQ27 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc191J3QQ27 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc191J3QQ27 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc191J3QQ27 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc191J3QQ27 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc191J3QQ27 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc191J3QQ27 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc191J3QQ27 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc191J3QQ27 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc191J3QQ27 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc191J3QQ27 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc191J3QQ27 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc191J3QQ27 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc191J3QQ27 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc191J3QQ27 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc191J3QQ27 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc191J3QQ27 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc191J3QQ27 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc191J3QQ27 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc191J3QQ27 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc191J3QQ27 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc191J3QQ27 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc191J3QQ27 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc191J3QQ27 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc191J3QQ27 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc191J3QQ27 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc191J3QQ27 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc191J3QQ27 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc191J3QQ27 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc191J3QQ27 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc191J3QQ27 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc191J3QQ27 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc191J3QQ27 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc191J3QQ27 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc191J3QQ27 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc191J3QQ27 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc191J3QQ27 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc191J3QQ27 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc191J3QQ27 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc191J3QQ27 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc191J3QQ27 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc191J3QQ27 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc191J3QQ27 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc191J3QQ27 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc191J3QQ27 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc191J3QQ27 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc191J3QQ27 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc191J3QQ27 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc191J3QQ27 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc191J3QQ27 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc191J3QQ27 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc191J3QQ27 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc191J3QQ27 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc191J3QQ27 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc191J3QQ27 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc191J3QQ27 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc191J3QQ27 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc191J3QQ27 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc191J3QQ27 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc191J3QQ27 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc191J3QQ27 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc191J3QQ27 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc191J3QQ27 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc191J3QQ27 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc191J3QQ27 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc191J3QQ27 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc191J3QQ27 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc191J3QQ27 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc191J3QQ27 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc191J3QQ27 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc191J3QQ27 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc191J3QQ27 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc191J3QQ27 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc191J3QQ27 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc191J3QQ27 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc191J3QQ27 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc191J3QQ27 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc191J3QQ27 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc191J3QQ27 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc191J3QQ27 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc191J3QQ27 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc191J3QQ27 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc191J3QQ27 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc191J3QQ27 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms