Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sclt1G5E861 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sclt1G5E861 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sclt1G5E861 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sclt1G5E861 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sclt1G5E861 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sclt1G5E861 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sclt1G5E861 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sclt1G5E861 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sclt1G5E861 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sclt1G5E861 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sclt1G5E861 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sclt1G5E861 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sclt1G5E861 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sclt1G5E861 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Sclt1G5E861 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sclt1G5E861 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sclt1G5E861 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sclt1G5E861 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sclt1G5E861 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sclt1G5E861 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sclt1G5E861 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sclt1G5E861 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sclt1G5E861 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sclt1G5E861 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sclt1G5E861 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sclt1G5E861 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sclt1G5E861 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sclt1G5E861 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sclt1G5E861 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sclt1G5E861 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sclt1G5E861 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sclt1G5E861 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sclt1G5E861 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sclt1G5E861 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sclt1G5E861 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sclt1G5E861 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sclt1G5E861 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sclt1G5E861 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sclt1G5E861 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sclt1G5E861 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sclt1G5E861 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sclt1G5E861 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sclt1G5E861 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sclt1G5E861 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sclt1G5E861 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sclt1G5E861 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sclt1G5E861 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sclt1G5E861 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sclt1G5E861 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sclt1G5E861 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sclt1G5E861 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sclt1G5E861 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms