Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sh3tc1G3X9F6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sh3tc1G3X9F6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sh3tc1G3X9F6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sh3tc1G3X9F6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sh3tc1G3X9F6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sh3tc1G3X9F6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sh3tc1G3X9F6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sh3tc1G3X9F6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sh3tc1G3X9F6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sh3tc1G3X9F6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sh3tc1G3X9F6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sh3tc1G3X9F6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sh3tc1G3X9F6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sh3tc1G3X9F6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sh3tc1G3X9F6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sh3tc1G3X9F6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sh3tc1G3X9F6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sh3tc1G3X9F6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sh3tc1G3X9F6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sh3tc1G3X9F6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sh3tc1G3X9F6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sh3tc1G3X9F6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sh3tc1G3X9F6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sh3tc1G3X9F6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sh3tc1G3X9F6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sh3tc1G3X9F6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sh3tc1G3X9F6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sh3tc1G3X9F6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sh3tc1G3X9F6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sh3tc1G3X9F6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sh3tc1G3X9F6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sh3tc1G3X9F6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sh3tc1G3X9F6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sh3tc1G3X9F6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sh3tc1G3X9F6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sh3tc1G3X9F6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sh3tc1G3X9F6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sh3tc1G3X9F6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sh3tc1G3X9F6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sh3tc1G3X9F6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Sh3tc1G3X9F6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sh3tc1G3X9F6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sh3tc1G3X9F6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sh3tc1G3X9F6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sh3tc1G3X9F6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sh3tc1G3X9F6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sh3tc1G3X9F6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sh3tc1G3X9F6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sh3tc1G3X9F6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sh3tc1G3X9F6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sh3tc1G3X9F6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sh3tc1G3X9F6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sh3tc1G3X9F6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sh3tc1G3X9F6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sh3tc1G3X9F6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sh3tc1G3X9F6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sh3tc1G3X9F6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sh3tc1G3X9F6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sh3tc1G3X9F6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sh3tc1G3X9F6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sh3tc1G3X9F6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sh3tc1G3X9F6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sh3tc1G3X9F6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sh3tc1G3X9F6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sh3tc1G3X9F6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sh3tc1G3X9F6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sh3tc1G3X9F6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sh3tc1G3X9F6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sh3tc1G3X9F6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sh3tc1G3X9F6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sh3tc1G3X9F6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sh3tc1G3X9F6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sh3tc1G3X9F6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Sh3tc1G3X9F6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sh3tc1G3X9F6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sh3tc1G3X9F6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Sh3tc1G3X9F6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sh3tc1G3X9F6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sh3tc1G3X9F6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sh3tc1G3X9F6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sh3tc1G3X9F6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sh3tc1G3X9F6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sh3tc1G3X9F6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sh3tc1G3X9F6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sh3tc1G3X9F6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sh3tc1G3X9F6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sh3tc1G3X9F6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sh3tc1G3X9F6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sh3tc1G3X9F6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sh3tc1G3X9F6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sh3tc1G3X9F6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sh3tc1G3X9F6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sh3tc1G3X9F6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sh3tc1G3X9F6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sh3tc1G3X9F6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sh3tc1G3X9F6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sh3tc1G3X9F6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Sh3tc1G3X9F6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Sh3tc1G3X9F6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms