Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Q1

Cabin1, Calcineurin binding protein 1, isoform CRA_a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,187 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabin1G3X8Q1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cabin1G3X8Q1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cabin1G3X8Q1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cabin1G3X8Q1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cabin1G3X8Q1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cabin1G3X8Q1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cabin1G3X8Q1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cabin1G3X8Q1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cabin1G3X8Q1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cabin1G3X8Q1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cabin1G3X8Q1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cabin1G3X8Q1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cabin1G3X8Q1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cabin1G3X8Q1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cabin1G3X8Q1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cabin1G3X8Q1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cabin1G3X8Q1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms