Protein–RNA interactions for Protein: G3UW31

Vmn1r176, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r176G3UW31 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r176G3UW31 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r176G3UW31 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r176G3UW31 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r176G3UW31 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r176G3UW31 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r176G3UW31 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r176G3UW31 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r176G3UW31 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r176G3UW31 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r176G3UW31 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r176G3UW31 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r176G3UW31 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r176G3UW31 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r176G3UW31 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r176G3UW31 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r176G3UW31 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r176G3UW31 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r176G3UW31 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r176G3UW31 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r176G3UW31 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r176G3UW31 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r176G3UW31 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r176G3UW31 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r176G3UW31 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r176G3UW31 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r176G3UW31 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r176G3UW31 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r176G3UW31 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r176G3UW31 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r176G3UW31 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r176G3UW31 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r176G3UW31 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r176G3UW31 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r176G3UW31 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r176G3UW31 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r176G3UW31 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r176G3UW31 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r176G3UW31 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r176G3UW31 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r176G3UW31 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r176G3UW31 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn1r176G3UW31 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn1r176G3UW31 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn1r176G3UW31 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn1r176G3UW31 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r176G3UW31 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r176G3UW31 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r176G3UW31 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r176G3UW31 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r176G3UW31 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r176G3UW31 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn1r176G3UW31 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn1r176G3UW31 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn1r176G3UW31 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn1r176G3UW31 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn1r176G3UW31 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r176G3UW31 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r176G3UW31 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r176G3UW31 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r176G3UW31 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r176G3UW31 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r176G3UW31 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r176G3UW31 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r176G3UW31 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r176G3UW31 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn1r176G3UW31 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn1r176G3UW31 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn1r176G3UW31 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn1r176G3UW31 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r176G3UW31 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r176G3UW31 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r176G3UW31 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r176G3UW31 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r176G3UW31 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r176G3UW31 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r176G3UW31 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r176G3UW31 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r176G3UW31 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r176G3UW31 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r176G3UW31 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r176G3UW31 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r176G3UW31 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r176G3UW31 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r176G3UW31 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r176G3UW31 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r176G3UW31 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r176G3UW31 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r176G3UW31 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r176G3UW31 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r176G3UW31 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r176G3UW31 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r176G3UW31 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r176G3UW31 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r176G3UW31 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r176G3UW31 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r176G3UW31 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r176G3UW31 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r176G3UW31 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r176G3UW31 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms