Protein–RNA interactions for Protein: F8VQG7

N4bp2, NEDD4-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp2F8VQG7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
N4bp2F8VQG7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
N4bp2F8VQG7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
N4bp2F8VQG7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
N4bp2F8VQG7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
N4bp2F8VQG7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
N4bp2F8VQG7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
N4bp2F8VQG7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
N4bp2F8VQG7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
N4bp2F8VQG7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
N4bp2F8VQG7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
N4bp2F8VQG7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
N4bp2F8VQG7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
N4bp2F8VQG7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
N4bp2F8VQG7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
N4bp2F8VQG7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
N4bp2F8VQG7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
N4bp2F8VQG7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
N4bp2F8VQG7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
N4bp2F8VQG7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
N4bp2F8VQG7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
N4bp2F8VQG7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
N4bp2F8VQG7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
N4bp2F8VQG7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
N4bp2F8VQG7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
N4bp2F8VQG7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
N4bp2F8VQG7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
N4bp2F8VQG7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
N4bp2F8VQG7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
N4bp2F8VQG7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
N4bp2F8VQG7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
N4bp2F8VQG7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
N4bp2F8VQG7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
N4bp2F8VQG7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
N4bp2F8VQG7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
N4bp2F8VQG7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
N4bp2F8VQG7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
N4bp2F8VQG7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
N4bp2F8VQG7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
N4bp2F8VQG7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
N4bp2F8VQG7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
N4bp2F8VQG7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
N4bp2F8VQG7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
N4bp2F8VQG7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
N4bp2F8VQG7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
N4bp2F8VQG7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
N4bp2F8VQG7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
N4bp2F8VQG7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
N4bp2F8VQG7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
N4bp2F8VQG7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
N4bp2F8VQG7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
N4bp2F8VQG7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
N4bp2F8VQG7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
N4bp2F8VQG7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
N4bp2F8VQG7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
N4bp2F8VQG7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
N4bp2F8VQG7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
N4bp2F8VQG7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
N4bp2F8VQG7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
N4bp2F8VQG7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
N4bp2F8VQG7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
N4bp2F8VQG7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
N4bp2F8VQG7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
N4bp2F8VQG7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
N4bp2F8VQG7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
N4bp2F8VQG7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
N4bp2F8VQG7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
N4bp2F8VQG7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
N4bp2F8VQG7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
N4bp2F8VQG7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
N4bp2F8VQG7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
N4bp2F8VQG7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
N4bp2F8VQG7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
N4bp2F8VQG7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
N4bp2F8VQG7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
N4bp2F8VQG7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
N4bp2F8VQG7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
N4bp2F8VQG7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
N4bp2F8VQG7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
N4bp2F8VQG7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
N4bp2F8VQG7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
N4bp2F8VQG7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
N4bp2F8VQG7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
N4bp2F8VQG7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
N4bp2F8VQG7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
N4bp2F8VQG7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
N4bp2F8VQG7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
N4bp2F8VQG7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
N4bp2F8VQG7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
N4bp2F8VQG7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
N4bp2F8VQG7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
N4bp2F8VQG7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
N4bp2F8VQG7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
N4bp2F8VQG7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
N4bp2F8VQG7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
N4bp2F8VQG7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
N4bp2F8VQG7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
N4bp2F8VQG7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
N4bp2F8VQG7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
N4bp2F8VQG7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms