Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LctF8VPT3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LctF8VPT3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LctF8VPT3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LctF8VPT3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LctF8VPT3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LctF8VPT3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LctF8VPT3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LctF8VPT3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LctF8VPT3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LctF8VPT3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LctF8VPT3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LctF8VPT3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LctF8VPT3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LctF8VPT3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LctF8VPT3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LctF8VPT3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LctF8VPT3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LctF8VPT3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LctF8VPT3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LctF8VPT3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LctF8VPT3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LctF8VPT3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LctF8VPT3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LctF8VPT3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LctF8VPT3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LctF8VPT3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LctF8VPT3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LctF8VPT3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LctF8VPT3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LctF8VPT3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LctF8VPT3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LctF8VPT3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LctF8VPT3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LctF8VPT3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LctF8VPT3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LctF8VPT3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LctF8VPT3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LctF8VPT3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LctF8VPT3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LctF8VPT3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LctF8VPT3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LctF8VPT3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LctF8VPT3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LctF8VPT3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LctF8VPT3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LctF8VPT3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LctF8VPT3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LctF8VPT3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LctF8VPT3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LctF8VPT3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LctF8VPT3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LctF8VPT3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LctF8VPT3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LctF8VPT3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LctF8VPT3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LctF8VPT3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LctF8VPT3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LctF8VPT3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LctF8VPT3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LctF8VPT3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LctF8VPT3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LctF8VPT3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LctF8VPT3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LctF8VPT3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LctF8VPT3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LctF8VPT3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LctF8VPT3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LctF8VPT3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LctF8VPT3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LctF8VPT3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LctF8VPT3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LctF8VPT3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LctF8VPT3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LctF8VPT3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LctF8VPT3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LctF8VPT3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LctF8VPT3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LctF8VPT3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LctF8VPT3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LctF8VPT3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LctF8VPT3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LctF8VPT3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LctF8VPT3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LctF8VPT3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LctF8VPT3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LctF8VPT3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LctF8VPT3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LctF8VPT3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LctF8VPT3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LctF8VPT3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LctF8VPT3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LctF8VPT3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LctF8VPT3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LctF8VPT3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LctF8VPT3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LctF8VPT3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LctF8VPT3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LctF8VPT3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LctF8VPT3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms