Protein–RNA interactions for Protein: F7BCK0

Dcdc2b, Doublecortin domain-containing 2b (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcdc2bF7BCK0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Dcdc2bF7BCK0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Dcdc2bF7BCK0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Dcdc2bF7BCK0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Dcdc2bF7BCK0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dcdc2bF7BCK0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dcdc2bF7BCK0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dcdc2bF7BCK0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Dcdc2bF7BCK0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Dcdc2bF7BCK0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Dcdc2bF7BCK0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Dcdc2bF7BCK0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Dcdc2bF7BCK0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Dcdc2bF7BCK0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dcdc2bF7BCK0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dcdc2bF7BCK0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dcdc2bF7BCK0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dcdc2bF7BCK0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dcdc2bF7BCK0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dcdc2bF7BCK0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Dcdc2bF7BCK0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dcdc2bF7BCK0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dcdc2bF7BCK0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dcdc2bF7BCK0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Dcdc2bF7BCK0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Dcdc2bF7BCK0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Dcdc2bF7BCK0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Dcdc2bF7BCK0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Dcdc2bF7BCK0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Dcdc2bF7BCK0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Dcdc2bF7BCK0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dcdc2bF7BCK0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dcdc2bF7BCK0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dcdc2bF7BCK0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dcdc2bF7BCK0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dcdc2bF7BCK0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dcdc2bF7BCK0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dcdc2bF7BCK0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dcdc2bF7BCK0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dcdc2bF7BCK0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dcdc2bF7BCK0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dcdc2bF7BCK0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dcdc2bF7BCK0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dcdc2bF7BCK0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dcdc2bF7BCK0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dcdc2bF7BCK0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Dcdc2bF7BCK0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dcdc2bF7BCK0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dcdc2bF7BCK0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dcdc2bF7BCK0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Dcdc2bF7BCK0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Dcdc2bF7BCK0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Dcdc2bF7BCK0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Dcdc2bF7BCK0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Dcdc2bF7BCK0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Dcdc2bF7BCK0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Dcdc2bF7BCK0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dcdc2bF7BCK0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Dcdc2bF7BCK0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dcdc2bF7BCK0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dcdc2bF7BCK0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dcdc2bF7BCK0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dcdc2bF7BCK0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dcdc2bF7BCK0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dcdc2bF7BCK0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dcdc2bF7BCK0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dcdc2bF7BCK0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dcdc2bF7BCK0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dcdc2bF7BCK0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dcdc2bF7BCK0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dcdc2bF7BCK0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dcdc2bF7BCK0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dcdc2bF7BCK0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dcdc2bF7BCK0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Dcdc2bF7BCK0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Dcdc2bF7BCK0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Dcdc2bF7BCK0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Dcdc2bF7BCK0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Dcdc2bF7BCK0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dcdc2bF7BCK0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dcdc2bF7BCK0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Dcdc2bF7BCK0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dcdc2bF7BCK0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Dcdc2bF7BCK0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Dcdc2bF7BCK0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Dcdc2bF7BCK0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Dcdc2bF7BCK0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Dcdc2bF7BCK0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Dcdc2bF7BCK0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dcdc2bF7BCK0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dcdc2bF7BCK0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dcdc2bF7BCK0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Dcdc2bF7BCK0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Dcdc2bF7BCK0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dcdc2bF7BCK0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Dcdc2bF7BCK0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Dcdc2bF7BCK0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Dcdc2bF7BCK0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Dcdc2bF7BCK0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Dcdc2bF7BCK0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms