Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm10378F6XQQ1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm10378F6XQQ1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm10378F6XQQ1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm10378F6XQQ1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm10378F6XQQ1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm10378F6XQQ1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm10378F6XQQ1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm10378F6XQQ1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm10378F6XQQ1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm10378F6XQQ1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm10378F6XQQ1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm10378F6XQQ1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm10378F6XQQ1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm10378F6XQQ1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm10378F6XQQ1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm10378F6XQQ1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm10378F6XQQ1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm10378F6XQQ1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm10378F6XQQ1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm10378F6XQQ1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm10378F6XQQ1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm10378F6XQQ1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm10378F6XQQ1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm10378F6XQQ1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm10378F6XQQ1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm10378F6XQQ1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm10378F6XQQ1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm10378F6XQQ1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm10378F6XQQ1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm10378F6XQQ1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm10378F6XQQ1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm10378F6XQQ1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm10378F6XQQ1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm10378F6XQQ1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm10378F6XQQ1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm10378F6XQQ1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm10378F6XQQ1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm10378F6XQQ1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm10378F6XQQ1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm10378F6XQQ1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm10378F6XQQ1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm10378F6XQQ1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm10378F6XQQ1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm10378F6XQQ1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm10378F6XQQ1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm10378F6XQQ1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm10378F6XQQ1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm10378F6XQQ1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm10378F6XQQ1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm10378F6XQQ1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm10378F6XQQ1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm10378F6XQQ1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm10378F6XQQ1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm10378F6XQQ1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm10378F6XQQ1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm10378F6XQQ1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm10378F6XQQ1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm10378F6XQQ1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm10378F6XQQ1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm10378F6XQQ1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm10378F6XQQ1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm10378F6XQQ1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm10378F6XQQ1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm10378F6XQQ1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm10378F6XQQ1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm10378F6XQQ1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gm10378F6XQQ1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gm10378F6XQQ1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm10378F6XQQ1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm10378F6XQQ1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm10378F6XQQ1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm10378F6XQQ1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm10378F6XQQ1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm10378F6XQQ1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm10378F6XQQ1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm10378F6XQQ1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm10378F6XQQ1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm10378F6XQQ1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm10378F6XQQ1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm10378F6XQQ1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm10378F6XQQ1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm10378F6XQQ1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm10378F6XQQ1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm10378F6XQQ1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm10378F6XQQ1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm10378F6XQQ1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm10378F6XQQ1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm10378F6XQQ1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm10378F6XQQ1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm10378F6XQQ1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm10378F6XQQ1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm10378F6XQQ1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm10378F6XQQ1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm10378F6XQQ1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm10378F6XQQ1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm10378F6XQQ1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm10378F6XQQ1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm10378F6XQQ1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm10378F6XQQ1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms