Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
Crocc2F6XLV1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Crocc2F6XLV1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Crocc2F6XLV1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Crocc2F6XLV1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Crocc2F6XLV1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Crocc2F6XLV1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Crocc2F6XLV1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Crocc2F6XLV1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Crocc2F6XLV1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Crocc2F6XLV1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Crocc2F6XLV1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Crocc2F6XLV1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Crocc2F6XLV1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Crocc2F6XLV1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Crocc2F6XLV1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Crocc2F6XLV1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Crocc2F6XLV1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Crocc2F6XLV1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Crocc2F6XLV1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Crocc2F6XLV1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
Crocc2F6XLV1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Crocc2F6XLV1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Crocc2F6XLV1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
Crocc2F6XLV1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Crocc2F6XLV1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Crocc2F6XLV1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Crocc2F6XLV1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Crocc2F6XLV1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Crocc2F6XLV1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
Crocc2F6XLV1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Crocc2F6XLV1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Crocc2F6XLV1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Crocc2F6XLV1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Crocc2F6XLV1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Crocc2F6XLV1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Crocc2F6XLV1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Crocc2F6XLV1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Crocc2F6XLV1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Crocc2F6XLV1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Crocc2F6XLV1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Crocc2F6XLV1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Crocc2F6XLV1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Crocc2F6XLV1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Crocc2F6XLV1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Crocc2F6XLV1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Crocc2F6XLV1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Crocc2F6XLV1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Crocc2F6XLV1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Crocc2F6XLV1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Crocc2F6XLV1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Crocc2F6XLV1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Crocc2F6XLV1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Crocc2F6XLV1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Crocc2F6XLV1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Crocc2F6XLV1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Crocc2F6XLV1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Crocc2F6XLV1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Crocc2F6XLV1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Crocc2F6XLV1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Crocc2F6XLV1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Crocc2F6XLV1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Crocc2F6XLV1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Crocc2F6XLV1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Crocc2F6XLV1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Crocc2F6XLV1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
Crocc2F6XLV1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Crocc2F6XLV1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Crocc2F6XLV1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Crocc2F6XLV1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Crocc2F6XLV1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Crocc2F6XLV1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Crocc2F6XLV1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Crocc2F6XLV1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Crocc2F6XLV1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
Crocc2F6XLV1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Crocc2F6XLV1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Crocc2F6XLV1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Crocc2F6XLV1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Crocc2F6XLV1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Crocc2F6XLV1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Crocc2F6XLV1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
Crocc2F6XLV1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
Crocc2F6XLV1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Crocc2F6XLV1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
Crocc2F6XLV1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
Crocc2F6XLV1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Crocc2F6XLV1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Crocc2F6XLV1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
Crocc2F6XLV1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Crocc2F6XLV1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Crocc2F6XLV1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Crocc2F6XLV1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Crocc2F6XLV1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Crocc2F6XLV1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Crocc2F6XLV1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
Crocc2F6XLV1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
Crocc2F6XLV1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC36.45■■■■□ 3.42
Crocc2F6XLV1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
Crocc2F6XLV1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms