Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pagr1bF6V0H0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pagr1bF6V0H0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pagr1bF6V0H0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pagr1bF6V0H0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pagr1bF6V0H0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pagr1bF6V0H0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pagr1bF6V0H0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pagr1bF6V0H0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pagr1bF6V0H0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pagr1bF6V0H0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pagr1bF6V0H0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pagr1bF6V0H0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pagr1bF6V0H0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Pagr1bF6V0H0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pagr1bF6V0H0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pagr1bF6V0H0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pagr1bF6V0H0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pagr1bF6V0H0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pagr1bF6V0H0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pagr1bF6V0H0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pagr1bF6V0H0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pagr1bF6V0H0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pagr1bF6V0H0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pagr1bF6V0H0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pagr1bF6V0H0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pagr1bF6V0H0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Pagr1bF6V0H0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pagr1bF6V0H0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pagr1bF6V0H0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pagr1bF6V0H0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pagr1bF6V0H0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pagr1bF6V0H0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pagr1bF6V0H0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pagr1bF6V0H0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pagr1bF6V0H0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pagr1bF6V0H0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pagr1bF6V0H0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pagr1bF6V0H0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pagr1bF6V0H0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pagr1bF6V0H0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pagr1bF6V0H0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pagr1bF6V0H0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pagr1bF6V0H0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pagr1bF6V0H0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Pagr1bF6V0H0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pagr1bF6V0H0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pagr1bF6V0H0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pagr1bF6V0H0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pagr1bF6V0H0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pagr1bF6V0H0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pagr1bF6V0H0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pagr1bF6V0H0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pagr1bF6V0H0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pagr1bF6V0H0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pagr1bF6V0H0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pagr1bF6V0H0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pagr1bF6V0H0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pagr1bF6V0H0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pagr1bF6V0H0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pagr1bF6V0H0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pagr1bF6V0H0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pagr1bF6V0H0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pagr1bF6V0H0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pagr1bF6V0H0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pagr1bF6V0H0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pagr1bF6V0H0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pagr1bF6V0H0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pagr1bF6V0H0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pagr1bF6V0H0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pagr1bF6V0H0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pagr1bF6V0H0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pagr1bF6V0H0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pagr1bF6V0H0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pagr1bF6V0H0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pagr1bF6V0H0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pagr1bF6V0H0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pagr1bF6V0H0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pagr1bF6V0H0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pagr1bF6V0H0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pagr1bF6V0H0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pagr1bF6V0H0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pagr1bF6V0H0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pagr1bF6V0H0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pagr1bF6V0H0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pagr1bF6V0H0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pagr1bF6V0H0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pagr1bF6V0H0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pagr1bF6V0H0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pagr1bF6V0H0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pagr1bF6V0H0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pagr1bF6V0H0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pagr1bF6V0H0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pagr1bF6V0H0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pagr1bF6V0H0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pagr1bF6V0H0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pagr1bF6V0H0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pagr1bF6V0H0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pagr1bF6V0H0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pagr1bF6V0H0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms