Protein–RNA interactions for Protein: E9QAA8

Gm4841, Interferon-gamma-inducible GTPase Ifgga3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4841E9QAA8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm4841E9QAA8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm4841E9QAA8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm4841E9QAA8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm4841E9QAA8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm4841E9QAA8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm4841E9QAA8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm4841E9QAA8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm4841E9QAA8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm4841E9QAA8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm4841E9QAA8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm4841E9QAA8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm4841E9QAA8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm4841E9QAA8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm4841E9QAA8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm4841E9QAA8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm4841E9QAA8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm4841E9QAA8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm4841E9QAA8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm4841E9QAA8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm4841E9QAA8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm4841E9QAA8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm4841E9QAA8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm4841E9QAA8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm4841E9QAA8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm4841E9QAA8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm4841E9QAA8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm4841E9QAA8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm4841E9QAA8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm4841E9QAA8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm4841E9QAA8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm4841E9QAA8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm4841E9QAA8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm4841E9QAA8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm4841E9QAA8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm4841E9QAA8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm4841E9QAA8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm4841E9QAA8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm4841E9QAA8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm4841E9QAA8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm4841E9QAA8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm4841E9QAA8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm4841E9QAA8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm4841E9QAA8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm4841E9QAA8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm4841E9QAA8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm4841E9QAA8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm4841E9QAA8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm4841E9QAA8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm4841E9QAA8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm4841E9QAA8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm4841E9QAA8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm4841E9QAA8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm4841E9QAA8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm4841E9QAA8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm4841E9QAA8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm4841E9QAA8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm4841E9QAA8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm4841E9QAA8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm4841E9QAA8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm4841E9QAA8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm4841E9QAA8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm4841E9QAA8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm4841E9QAA8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm4841E9QAA8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm4841E9QAA8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm4841E9QAA8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm4841E9QAA8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm4841E9QAA8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm4841E9QAA8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm4841E9QAA8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm4841E9QAA8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm4841E9QAA8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm4841E9QAA8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm4841E9QAA8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm4841E9QAA8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm4841E9QAA8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm4841E9QAA8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm4841E9QAA8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm4841E9QAA8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm4841E9QAA8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm4841E9QAA8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm4841E9QAA8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm4841E9QAA8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm4841E9QAA8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm4841E9QAA8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm4841E9QAA8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm4841E9QAA8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm4841E9QAA8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm4841E9QAA8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm4841E9QAA8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm4841E9QAA8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm4841E9QAA8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm4841E9QAA8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm4841E9QAA8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm4841E9QAA8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm4841E9QAA8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm4841E9QAA8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm4841E9QAA8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm4841E9QAA8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms