Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P2

Cacna1i, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1iE9Q7P2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna1iE9Q7P2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1iE9Q7P2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1iE9Q7P2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1iE9Q7P2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1iE9Q7P2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1iE9Q7P2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1iE9Q7P2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1iE9Q7P2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1iE9Q7P2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1iE9Q7P2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacna1iE9Q7P2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna1iE9Q7P2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna1iE9Q7P2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacna1iE9Q7P2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1iE9Q7P2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1iE9Q7P2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1iE9Q7P2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1iE9Q7P2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1iE9Q7P2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacna1iE9Q7P2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1iE9Q7P2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1iE9Q7P2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1iE9Q7P2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1iE9Q7P2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1iE9Q7P2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1iE9Q7P2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1iE9Q7P2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1iE9Q7P2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacna1iE9Q7P2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1iE9Q7P2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1iE9Q7P2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1iE9Q7P2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1iE9Q7P2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1iE9Q7P2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1iE9Q7P2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacna1iE9Q7P2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna1iE9Q7P2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacna1iE9Q7P2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms