Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4U5

Vmn2r56, Vomeronasal 2, receptor 56, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r56E9Q4U5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn2r56E9Q4U5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn2r56E9Q4U5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn2r56E9Q4U5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn2r56E9Q4U5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn2r56E9Q4U5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn2r56E9Q4U5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn2r56E9Q4U5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn2r56E9Q4U5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn2r56E9Q4U5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn2r56E9Q4U5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn2r56E9Q4U5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn2r56E9Q4U5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn2r56E9Q4U5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmn2r56E9Q4U5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmn2r56E9Q4U5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmn2r56E9Q4U5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmn2r56E9Q4U5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmn2r56E9Q4U5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmn2r56E9Q4U5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn2r56E9Q4U5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn2r56E9Q4U5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn2r56E9Q4U5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn2r56E9Q4U5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn2r56E9Q4U5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn2r56E9Q4U5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn2r56E9Q4U5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn2r56E9Q4U5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vmn2r56E9Q4U5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vmn2r56E9Q4U5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vmn2r56E9Q4U5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vmn2r56E9Q4U5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vmn2r56E9Q4U5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vmn2r56E9Q4U5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Vmn2r56E9Q4U5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vmn2r56E9Q4U5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vmn2r56E9Q4U5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vmn2r56E9Q4U5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vmn2r56E9Q4U5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn2r56E9Q4U5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn2r56E9Q4U5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn2r56E9Q4U5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn2r56E9Q4U5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn2r56E9Q4U5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn2r56E9Q4U5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vmn2r56E9Q4U5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn2r56E9Q4U5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn2r56E9Q4U5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn2r56E9Q4U5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn2r56E9Q4U5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn2r56E9Q4U5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn2r56E9Q4U5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn2r56E9Q4U5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmn2r56E9Q4U5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.5 ms