Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Tarbp1E9Q368 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Tarbp1E9Q368 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Tarbp1E9Q368 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Tarbp1E9Q368 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Tarbp1E9Q368 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Tarbp1E9Q368 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Tarbp1E9Q368 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Tarbp1E9Q368 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Tarbp1E9Q368 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Tarbp1E9Q368 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Tarbp1E9Q368 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Tarbp1E9Q368 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Tarbp1E9Q368 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Tarbp1E9Q368 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Tarbp1E9Q368 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Tarbp1E9Q368 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Tarbp1E9Q368 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Tarbp1E9Q368 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Tarbp1E9Q368 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Tarbp1E9Q368 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Tarbp1E9Q368 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Tarbp1E9Q368 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Tarbp1E9Q368 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Tarbp1E9Q368 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Tarbp1E9Q368 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Tarbp1E9Q368 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Tarbp1E9Q368 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Tarbp1E9Q368 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Tarbp1E9Q368 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Tarbp1E9Q368 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Tarbp1E9Q368 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Tarbp1E9Q368 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Tarbp1E9Q368 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Tarbp1E9Q368 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Tarbp1E9Q368 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
Tarbp1E9Q368 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Tarbp1E9Q368 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Tarbp1E9Q368 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Tarbp1E9Q368 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Tarbp1E9Q368 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Tarbp1E9Q368 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Tarbp1E9Q368 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Tarbp1E9Q368 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Tarbp1E9Q368 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Tarbp1E9Q368 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Tarbp1E9Q368 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Tarbp1E9Q368 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Tarbp1E9Q368 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Tarbp1E9Q368 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Tarbp1E9Q368 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Tarbp1E9Q368 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Tarbp1E9Q368 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Tarbp1E9Q368 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Tarbp1E9Q368 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Tarbp1E9Q368 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Tarbp1E9Q368 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Tarbp1E9Q368 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Tarbp1E9Q368 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Tarbp1E9Q368 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Tarbp1E9Q368 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Tarbp1E9Q368 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Tarbp1E9Q368 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Tarbp1E9Q368 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Tarbp1E9Q368 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Tarbp1E9Q368 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Tarbp1E9Q368 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
Tarbp1E9Q368 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Tarbp1E9Q368 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Tarbp1E9Q368 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Tarbp1E9Q368 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Tarbp1E9Q368 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Tarbp1E9Q368 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Tarbp1E9Q368 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Tarbp1E9Q368 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Tarbp1E9Q368 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Tarbp1E9Q368 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Tarbp1E9Q368 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Tarbp1E9Q368 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Tarbp1E9Q368 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Tarbp1E9Q368 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Tarbp1E9Q368 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Tarbp1E9Q368 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Tarbp1E9Q368 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Tarbp1E9Q368 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Tarbp1E9Q368 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Tarbp1E9Q368 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Tarbp1E9Q368 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Tarbp1E9Q368 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Tarbp1E9Q368 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Tarbp1E9Q368 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Tarbp1E9Q368 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Tarbp1E9Q368 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Tarbp1E9Q368 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Tarbp1E9Q368 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Tarbp1E9Q368 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Tarbp1E9Q368 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Tarbp1E9Q368 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Tarbp1E9Q368 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Tarbp1E9Q368 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms