Protein–RNA interactions for Protein: E9Q235

Vmn1r88, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r88E9Q235 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r88E9Q235 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r88E9Q235 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r88E9Q235 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r88E9Q235 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r88E9Q235 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r88E9Q235 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r88E9Q235 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r88E9Q235 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r88E9Q235 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r88E9Q235 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r88E9Q235 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r88E9Q235 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r88E9Q235 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r88E9Q235 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r88E9Q235 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r88E9Q235 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r88E9Q235 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r88E9Q235 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r88E9Q235 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r88E9Q235 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r88E9Q235 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r88E9Q235 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r88E9Q235 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r88E9Q235 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Vmn1r88E9Q235 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r88E9Q235 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r88E9Q235 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r88E9Q235 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r88E9Q235 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r88E9Q235 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r88E9Q235 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r88E9Q235 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r88E9Q235 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r88E9Q235 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r88E9Q235 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r88E9Q235 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r88E9Q235 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r88E9Q235 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r88E9Q235 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r88E9Q235 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r88E9Q235 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r88E9Q235 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r88E9Q235 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r88E9Q235 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r88E9Q235 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r88E9Q235 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r88E9Q235 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r88E9Q235 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r88E9Q235 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r88E9Q235 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r88E9Q235 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r88E9Q235 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r88E9Q235 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r88E9Q235 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r88E9Q235 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r88E9Q235 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r88E9Q235 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r88E9Q235 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r88E9Q235 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r88E9Q235 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r88E9Q235 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r88E9Q235 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r88E9Q235 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r88E9Q235 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r88E9Q235 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r88E9Q235 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r88E9Q235 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r88E9Q235 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r88E9Q235 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r88E9Q235 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r88E9Q235 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r88E9Q235 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r88E9Q235 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r88E9Q235 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r88E9Q235 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r88E9Q235 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r88E9Q235 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r88E9Q235 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r88E9Q235 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r88E9Q235 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r88E9Q235 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r88E9Q235 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r88E9Q235 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r88E9Q235 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r88E9Q235 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r88E9Q235 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r88E9Q235 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r88E9Q235 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r88E9Q235 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r88E9Q235 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r88E9Q235 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r88E9Q235 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r88E9Q235 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r88E9Q235 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r88E9Q235 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r88E9Q235 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r88E9Q235 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r88E9Q235 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r88E9Q235 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.6 ms