Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd2E9Q1M1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd2E9Q1M1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd2E9Q1M1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd2E9Q1M1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd2E9Q1M1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd2E9Q1M1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd2E9Q1M1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd2E9Q1M1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd2E9Q1M1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd2E9Q1M1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd2E9Q1M1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd2E9Q1M1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd2E9Q1M1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd2E9Q1M1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd2E9Q1M1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd2E9Q1M1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd2E9Q1M1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd2E9Q1M1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd2E9Q1M1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd2E9Q1M1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd2E9Q1M1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd2E9Q1M1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd2E9Q1M1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd2E9Q1M1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd2E9Q1M1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd2E9Q1M1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzd2E9Q1M1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzd2E9Q1M1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzd2E9Q1M1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzd2E9Q1M1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzd2E9Q1M1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzd2E9Q1M1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzd2E9Q1M1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzd2E9Q1M1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdzd2E9Q1M1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd2E9Q1M1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd2E9Q1M1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd2E9Q1M1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd2E9Q1M1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd2E9Q1M1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd2E9Q1M1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd2E9Q1M1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd2E9Q1M1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdzd2E9Q1M1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd2E9Q1M1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd2E9Q1M1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd2E9Q1M1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd2E9Q1M1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd2E9Q1M1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd2E9Q1M1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdzd2E9Q1M1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzd2E9Q1M1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzd2E9Q1M1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzd2E9Q1M1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzd2E9Q1M1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdzd2E9Q1M1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd2E9Q1M1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd2E9Q1M1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdzd2E9Q1M1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd2E9Q1M1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd2E9Q1M1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd2E9Q1M1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd2E9Q1M1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd2E9Q1M1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd2E9Q1M1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdzd2E9Q1M1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd2E9Q1M1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd2E9Q1M1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd2E9Q1M1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdzd2E9Q1M1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd2E9Q1M1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd2E9Q1M1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdzd2E9Q1M1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd2E9Q1M1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd2E9Q1M1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd2E9Q1M1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd2E9Q1M1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd2E9Q1M1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd2E9Q1M1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd2E9Q1M1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzd2E9Q1M1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdzd2E9Q1M1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdzd2E9Q1M1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdzd2E9Q1M1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdzd2E9Q1M1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdzd2E9Q1M1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzd2E9Q1M1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzd2E9Q1M1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzd2E9Q1M1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzd2E9Q1M1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzd2E9Q1M1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd2E9Q1M1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd2E9Q1M1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd2E9Q1M1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd2E9Q1M1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd2E9Q1M1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd2E9Q1M1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd2E9Q1M1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzd2E9Q1M1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms