Protein–RNA interactions for Protein: E9PY46

Ift140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift140E9PY46 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Ift140E9PY46 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Ift140E9PY46 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ift140E9PY46 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
Ift140E9PY46 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ift140E9PY46 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ift140E9PY46 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ift140E9PY46 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Ift140E9PY46 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Ift140E9PY46 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Ift140E9PY46 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Ift140E9PY46 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Ift140E9PY46 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Ift140E9PY46 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Ift140E9PY46 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ift140E9PY46 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
Ift140E9PY46 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ift140E9PY46 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ift140E9PY46 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
Ift140E9PY46 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
Ift140E9PY46 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ift140E9PY46 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ift140E9PY46 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ift140E9PY46 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ift140E9PY46 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ift140E9PY46 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ift140E9PY46 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ift140E9PY46 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ift140E9PY46 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ift140E9PY46 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ift140E9PY46 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ift140E9PY46 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ift140E9PY46 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ift140E9PY46 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ift140E9PY46 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Ift140E9PY46 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ift140E9PY46 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ift140E9PY46 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ift140E9PY46 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ift140E9PY46 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ift140E9PY46 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ift140E9PY46 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
Ift140E9PY46 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ift140E9PY46 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
Ift140E9PY46 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Ift140E9PY46 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Ift140E9PY46 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ift140E9PY46 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ift140E9PY46 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ift140E9PY46 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Ift140E9PY46 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Ift140E9PY46 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Ift140E9PY46 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
Ift140E9PY46 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Ift140E9PY46 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ift140E9PY46 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ift140E9PY46 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ift140E9PY46 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Ift140E9PY46 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Ift140E9PY46 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Ift140E9PY46 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
Ift140E9PY46 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Ift140E9PY46 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Ift140E9PY46 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Ift140E9PY46 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Ift140E9PY46 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Ift140E9PY46 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Ift140E9PY46 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Ift140E9PY46 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Ift140E9PY46 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Ift140E9PY46 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
Ift140E9PY46 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
Ift140E9PY46 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ift140E9PY46 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ift140E9PY46 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ift140E9PY46 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
Ift140E9PY46 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Ift140E9PY46 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Ift140E9PY46 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
Ift140E9PY46 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Ift140E9PY46 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Ift140E9PY46 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ift140E9PY46 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ift140E9PY46 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ift140E9PY46 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Ift140E9PY46 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ift140E9PY46 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ift140E9PY46 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
Ift140E9PY46 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Ift140E9PY46 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ift140E9PY46 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ift140E9PY46 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Ift140E9PY46 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Ift140E9PY46 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Ift140E9PY46 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Ift140E9PY46 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Ift140E9PY46 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ift140E9PY46 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ift140E9PY46 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ift140E9PY46 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms