Protein–RNA interactions for Protein: E9PXJ7

Gm20458, Predicted gene 20458, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20458E9PXJ7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20458E9PXJ7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20458E9PXJ7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20458E9PXJ7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20458E9PXJ7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20458E9PXJ7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20458E9PXJ7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20458E9PXJ7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20458E9PXJ7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20458E9PXJ7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20458E9PXJ7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20458E9PXJ7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20458E9PXJ7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20458E9PXJ7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20458E9PXJ7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20458E9PXJ7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20458E9PXJ7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20458E9PXJ7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20458E9PXJ7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20458E9PXJ7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20458E9PXJ7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20458E9PXJ7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20458E9PXJ7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20458E9PXJ7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20458E9PXJ7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20458E9PXJ7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20458E9PXJ7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm20458E9PXJ7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20458E9PXJ7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20458E9PXJ7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20458E9PXJ7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20458E9PXJ7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm20458E9PXJ7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20458E9PXJ7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20458E9PXJ7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20458E9PXJ7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20458E9PXJ7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20458E9PXJ7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20458E9PXJ7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms