Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Srp54bE9PXC0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Srp54bE9PXC0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Srp54bE9PXC0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Srp54bE9PXC0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Srp54bE9PXC0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Srp54bE9PXC0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Srp54bE9PXC0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Srp54bE9PXC0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Srp54bE9PXC0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Srp54bE9PXC0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Srp54bE9PXC0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Srp54bE9PXC0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Srp54bE9PXC0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Srp54bE9PXC0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Srp54bE9PXC0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Srp54bE9PXC0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srp54bE9PXC0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srp54bE9PXC0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srp54bE9PXC0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srp54bE9PXC0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srp54bE9PXC0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srp54bE9PXC0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srp54bE9PXC0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Srp54bE9PXC0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srp54bE9PXC0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srp54bE9PXC0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srp54bE9PXC0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srp54bE9PXC0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srp54bE9PXC0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srp54bE9PXC0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srp54bE9PXC0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srp54bE9PXC0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srp54bE9PXC0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srp54bE9PXC0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srp54bE9PXC0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srp54bE9PXC0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srp54bE9PXC0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srp54bE9PXC0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srp54bE9PXC0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srp54bE9PXC0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srp54bE9PXC0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srp54bE9PXC0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srp54bE9PXC0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srp54bE9PXC0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srp54bE9PXC0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Srp54bE9PXC0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srp54bE9PXC0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srp54bE9PXC0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srp54bE9PXC0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srp54bE9PXC0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srp54bE9PXC0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Srp54bE9PXC0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srp54bE9PXC0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srp54bE9PXC0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srp54bE9PXC0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srp54bE9PXC0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srp54bE9PXC0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Srp54bE9PXC0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srp54bE9PXC0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srp54bE9PXC0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srp54bE9PXC0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Srp54bE9PXC0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srp54bE9PXC0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srp54bE9PXC0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srp54bE9PXC0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srp54bE9PXC0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srp54bE9PXC0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srp54bE9PXC0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Srp54bE9PXC0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srp54bE9PXC0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srp54bE9PXC0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srp54bE9PXC0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srp54bE9PXC0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srp54bE9PXC0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srp54bE9PXC0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srp54bE9PXC0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Srp54bE9PXC0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srp54bE9PXC0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srp54bE9PXC0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srp54bE9PXC0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Srp54bE9PXC0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Srp54bE9PXC0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Srp54bE9PXC0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Srp54bE9PXC0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Srp54bE9PXC0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Srp54bE9PXC0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Srp54bE9PXC0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Srp54bE9PXC0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Srp54bE9PXC0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Srp54bE9PXC0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Srp54bE9PXC0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Srp54bE9PXC0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Srp54bE9PXC0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Srp54bE9PXC0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Srp54bE9PXC0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Srp54bE9PXC0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Srp54bE9PXC0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Srp54bE9PXC0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Srp54bE9PXC0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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