Protein–RNA interactions for Protein: E9PWQ3

Col6a3, Collagen, type VI, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 3,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a3E9PWQ3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col6a3E9PWQ3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col6a3E9PWQ3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col6a3E9PWQ3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col6a3E9PWQ3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col6a3E9PWQ3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col6a3E9PWQ3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col6a3E9PWQ3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col6a3E9PWQ3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col6a3E9PWQ3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col6a3E9PWQ3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col6a3E9PWQ3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Col6a3E9PWQ3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col6a3E9PWQ3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col6a3E9PWQ3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col6a3E9PWQ3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col6a3E9PWQ3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col6a3E9PWQ3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col6a3E9PWQ3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col6a3E9PWQ3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col6a3E9PWQ3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Col6a3E9PWQ3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col6a3E9PWQ3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col6a3E9PWQ3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col6a3E9PWQ3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col6a3E9PWQ3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col6a3E9PWQ3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col6a3E9PWQ3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Col6a3E9PWQ3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col6a3E9PWQ3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col6a3E9PWQ3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col6a3E9PWQ3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col6a3E9PWQ3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col6a3E9PWQ3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Col6a3E9PWQ3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col6a3E9PWQ3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col6a3E9PWQ3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col6a3E9PWQ3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col6a3E9PWQ3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col6a3E9PWQ3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col6a3E9PWQ3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col6a3E9PWQ3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col6a3E9PWQ3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col6a3E9PWQ3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col6a3E9PWQ3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col6a3E9PWQ3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col6a3E9PWQ3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col6a3E9PWQ3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col6a3E9PWQ3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col6a3E9PWQ3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col6a3E9PWQ3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col6a3E9PWQ3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col6a3E9PWQ3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col6a3E9PWQ3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col6a3E9PWQ3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col6a3E9PWQ3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col6a3E9PWQ3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col6a3E9PWQ3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col6a3E9PWQ3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col6a3E9PWQ3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col6a3E9PWQ3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col6a3E9PWQ3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col6a3E9PWQ3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col6a3E9PWQ3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Col6a3E9PWQ3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col6a3E9PWQ3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col6a3E9PWQ3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col6a3E9PWQ3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col6a3E9PWQ3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col6a3E9PWQ3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col6a3E9PWQ3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col6a3E9PWQ3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col6a3E9PWQ3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col6a3E9PWQ3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col6a3E9PWQ3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col6a3E9PWQ3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col6a3E9PWQ3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Col6a3E9PWQ3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col6a3E9PWQ3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col6a3E9PWQ3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col6a3E9PWQ3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col6a3E9PWQ3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col6a3E9PWQ3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col6a3E9PWQ3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col6a3E9PWQ3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Col6a3E9PWQ3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col6a3E9PWQ3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col6a3E9PWQ3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col6a3E9PWQ3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col6a3E9PWQ3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col6a3E9PWQ3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col6a3E9PWQ3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col6a3E9PWQ3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col6a3E9PWQ3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Col6a3E9PWQ3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col6a3E9PWQ3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Col6a3E9PWQ3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Col6a3E9PWQ3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col6a3E9PWQ3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Col6a3E9PWQ3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms