Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc144bE9PVZ3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc144bE9PVZ3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc144bE9PVZ3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc144bE9PVZ3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc144bE9PVZ3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc144bE9PVZ3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc144bE9PVZ3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc144bE9PVZ3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc144bE9PVZ3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc144bE9PVZ3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc144bE9PVZ3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc144bE9PVZ3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc144bE9PVZ3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc144bE9PVZ3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc144bE9PVZ3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc144bE9PVZ3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc144bE9PVZ3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc144bE9PVZ3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc144bE9PVZ3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc144bE9PVZ3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc144bE9PVZ3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc144bE9PVZ3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc144bE9PVZ3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc144bE9PVZ3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc144bE9PVZ3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc144bE9PVZ3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc144bE9PVZ3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc144bE9PVZ3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc144bE9PVZ3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc144bE9PVZ3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc144bE9PVZ3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc144bE9PVZ3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc144bE9PVZ3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc144bE9PVZ3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc144bE9PVZ3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc144bE9PVZ3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc144bE9PVZ3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc144bE9PVZ3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc144bE9PVZ3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc144bE9PVZ3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc144bE9PVZ3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc144bE9PVZ3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc144bE9PVZ3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc144bE9PVZ3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc144bE9PVZ3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc144bE9PVZ3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc144bE9PVZ3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc144bE9PVZ3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc144bE9PVZ3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc144bE9PVZ3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc144bE9PVZ3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc144bE9PVZ3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc144bE9PVZ3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc144bE9PVZ3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc144bE9PVZ3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc144bE9PVZ3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc144bE9PVZ3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc144bE9PVZ3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc144bE9PVZ3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc144bE9PVZ3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc144bE9PVZ3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc144bE9PVZ3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc144bE9PVZ3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc144bE9PVZ3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc144bE9PVZ3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc144bE9PVZ3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc144bE9PVZ3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc144bE9PVZ3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc144bE9PVZ3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc144bE9PVZ3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc144bE9PVZ3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc144bE9PVZ3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc144bE9PVZ3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc144bE9PVZ3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc144bE9PVZ3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc144bE9PVZ3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc144bE9PVZ3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc144bE9PVZ3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc144bE9PVZ3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc144bE9PVZ3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc144bE9PVZ3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc144bE9PVZ3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc144bE9PVZ3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc144bE9PVZ3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc144bE9PVZ3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc144bE9PVZ3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms