Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clca3bE9PUL3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clca3bE9PUL3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clca3bE9PUL3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clca3bE9PUL3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clca3bE9PUL3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clca3bE9PUL3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clca3bE9PUL3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clca3bE9PUL3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clca3bE9PUL3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clca3bE9PUL3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clca3bE9PUL3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clca3bE9PUL3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clca3bE9PUL3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clca3bE9PUL3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clca3bE9PUL3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clca3bE9PUL3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clca3bE9PUL3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clca3bE9PUL3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clca3bE9PUL3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clca3bE9PUL3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clca3bE9PUL3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Clca3bE9PUL3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clca3bE9PUL3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clca3bE9PUL3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clca3bE9PUL3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clca3bE9PUL3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clca3bE9PUL3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clca3bE9PUL3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clca3bE9PUL3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clca3bE9PUL3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clca3bE9PUL3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Clca3bE9PUL3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clca3bE9PUL3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clca3bE9PUL3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clca3bE9PUL3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clca3bE9PUL3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clca3bE9PUL3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clca3bE9PUL3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clca3bE9PUL3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clca3bE9PUL3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clca3bE9PUL3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clca3bE9PUL3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clca3bE9PUL3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clca3bE9PUL3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clca3bE9PUL3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clca3bE9PUL3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Clca3bE9PUL3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clca3bE9PUL3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clca3bE9PUL3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clca3bE9PUL3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clca3bE9PUL3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clca3bE9PUL3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clca3bE9PUL3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clca3bE9PUL3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clca3bE9PUL3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clca3bE9PUL3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clca3bE9PUL3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clca3bE9PUL3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clca3bE9PUL3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clca3bE9PUL3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clca3bE9PUL3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clca3bE9PUL3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clca3bE9PUL3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clca3bE9PUL3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clca3bE9PUL3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clca3bE9PUL3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clca3bE9PUL3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clca3bE9PUL3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clca3bE9PUL3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clca3bE9PUL3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Clca3bE9PUL3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clca3bE9PUL3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clca3bE9PUL3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clca3bE9PUL3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clca3bE9PUL3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clca3bE9PUL3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clca3bE9PUL3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clca3bE9PUL3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clca3bE9PUL3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clca3bE9PUL3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clca3bE9PUL3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clca3bE9PUL3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clca3bE9PUL3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Clca3bE9PUL3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clca3bE9PUL3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clca3bE9PUL3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clca3bE9PUL3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Clca3bE9PUL3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clca3bE9PUL3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clca3bE9PUL3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clca3bE9PUL3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Clca3bE9PUL3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clca3bE9PUL3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clca3bE9PUL3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clca3bE9PUL3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clca3bE9PUL3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clca3bE9PUL3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clca3bE9PUL3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clca3bE9PUL3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 354.7 ms