Protein–RNA interactions for Protein: E0CX23

Umad1, MCG2776, isoform CRA_c, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Umad1E0CX23 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Umad1E0CX23 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Umad1E0CX23 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Umad1E0CX23 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Umad1E0CX23 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Umad1E0CX23 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Umad1E0CX23 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Umad1E0CX23 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Umad1E0CX23 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Umad1E0CX23 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Umad1E0CX23 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Umad1E0CX23 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Umad1E0CX23 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Umad1E0CX23 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Umad1E0CX23 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Umad1E0CX23 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Umad1E0CX23 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Umad1E0CX23 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Umad1E0CX23 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Umad1E0CX23 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Umad1E0CX23 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Umad1E0CX23 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Umad1E0CX23 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Umad1E0CX23 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Umad1E0CX23 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Umad1E0CX23 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Umad1E0CX23 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Umad1E0CX23 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Umad1E0CX23 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Umad1E0CX23 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Umad1E0CX23 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Umad1E0CX23 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Umad1E0CX23 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Umad1E0CX23 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Umad1E0CX23 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Umad1E0CX23 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Umad1E0CX23 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Umad1E0CX23 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Umad1E0CX23 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Umad1E0CX23 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Umad1E0CX23 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Umad1E0CX23 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Umad1E0CX23 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Umad1E0CX23 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Umad1E0CX23 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Umad1E0CX23 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Umad1E0CX23 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Umad1E0CX23 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Umad1E0CX23 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Umad1E0CX23 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Umad1E0CX23 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Umad1E0CX23 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Umad1E0CX23 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Umad1E0CX23 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms