Protein–RNA interactions for Protein: D3Z622

4930455H04Rik, MCG1045678, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930455H04RikD3Z622 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4930455H04RikD3Z622 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930455H04RikD3Z622 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930455H04RikD3Z622 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930455H04RikD3Z622 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930455H04RikD3Z622 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930455H04RikD3Z622 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930455H04RikD3Z622 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930455H04RikD3Z622 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
4930455H04RikD3Z622 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930455H04RikD3Z622 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930455H04RikD3Z622 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930455H04RikD3Z622 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930455H04RikD3Z622 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930455H04RikD3Z622 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930455H04RikD3Z622 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930455H04RikD3Z622 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930455H04RikD3Z622 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930455H04RikD3Z622 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930455H04RikD3Z622 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930455H04RikD3Z622 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930455H04RikD3Z622 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930455H04RikD3Z622 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930455H04RikD3Z622 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930455H04RikD3Z622 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930455H04RikD3Z622 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930455H04RikD3Z622 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
4930455H04RikD3Z622 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930455H04RikD3Z622 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930455H04RikD3Z622 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930455H04RikD3Z622 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930455H04RikD3Z622 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930455H04RikD3Z622 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930455H04RikD3Z622 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930455H04RikD3Z622 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930455H04RikD3Z622 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930455H04RikD3Z622 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930455H04RikD3Z622 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930455H04RikD3Z622 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930455H04RikD3Z622 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
4930455H04RikD3Z622 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930455H04RikD3Z622 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930455H04RikD3Z622 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
4930455H04RikD3Z622 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930455H04RikD3Z622 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930455H04RikD3Z622 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930455H04RikD3Z622 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930455H04RikD3Z622 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930455H04RikD3Z622 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930455H04RikD3Z622 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930455H04RikD3Z622 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930455H04RikD3Z622 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930455H04RikD3Z622 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930455H04RikD3Z622 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930455H04RikD3Z622 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930455H04RikD3Z622 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms