Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1P8

4930467E23Rik, RIKEN cDNA 4930467E23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930467E23RikD3Z1P8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930467E23RikD3Z1P8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930467E23RikD3Z1P8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4930467E23RikD3Z1P8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930467E23RikD3Z1P8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930467E23RikD3Z1P8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930467E23RikD3Z1P8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930467E23RikD3Z1P8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930467E23RikD3Z1P8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
4930467E23RikD3Z1P8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930467E23RikD3Z1P8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4930467E23RikD3Z1P8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4930467E23RikD3Z1P8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
4930467E23RikD3Z1P8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4930467E23RikD3Z1P8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
4930467E23RikD3Z1P8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
4930467E23RikD3Z1P8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930467E23RikD3Z1P8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930467E23RikD3Z1P8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930467E23RikD3Z1P8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930467E23RikD3Z1P8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930467E23RikD3Z1P8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930467E23RikD3Z1P8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4930467E23RikD3Z1P8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930467E23RikD3Z1P8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930467E23RikD3Z1P8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930467E23RikD3Z1P8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930467E23RikD3Z1P8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930467E23RikD3Z1P8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930467E23RikD3Z1P8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930467E23RikD3Z1P8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930467E23RikD3Z1P8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
4930467E23RikD3Z1P8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930467E23RikD3Z1P8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930467E23RikD3Z1P8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
4930467E23RikD3Z1P8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930467E23RikD3Z1P8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930467E23RikD3Z1P8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930467E23RikD3Z1P8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930467E23RikD3Z1P8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930467E23RikD3Z1P8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930467E23RikD3Z1P8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930467E23RikD3Z1P8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930467E23RikD3Z1P8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
4930467E23RikD3Z1P8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
4930467E23RikD3Z1P8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930467E23RikD3Z1P8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930467E23RikD3Z1P8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930467E23RikD3Z1P8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930467E23RikD3Z1P8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930467E23RikD3Z1P8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930467E23RikD3Z1P8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930467E23RikD3Z1P8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930467E23RikD3Z1P8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
4930467E23RikD3Z1P8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930467E23RikD3Z1P8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930467E23RikD3Z1P8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
4930467E23RikD3Z1P8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930467E23RikD3Z1P8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930467E23RikD3Z1P8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930467E23RikD3Z1P8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930467E23RikD3Z1P8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930467E23RikD3Z1P8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930467E23RikD3Z1P8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930467E23RikD3Z1P8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930467E23RikD3Z1P8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930467E23RikD3Z1P8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930467E23RikD3Z1P8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930467E23RikD3Z1P8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930467E23RikD3Z1P8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930467E23RikD3Z1P8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
4930467E23RikD3Z1P8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930467E23RikD3Z1P8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930467E23RikD3Z1P8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930467E23RikD3Z1P8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930467E23RikD3Z1P8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930467E23RikD3Z1P8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930467E23RikD3Z1P8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930467E23RikD3Z1P8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930467E23RikD3Z1P8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
4930467E23RikD3Z1P8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4930467E23RikD3Z1P8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
4930467E23RikD3Z1P8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930467E23RikD3Z1P8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930467E23RikD3Z1P8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930467E23RikD3Z1P8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930467E23RikD3Z1P8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930467E23RikD3Z1P8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
4930467E23RikD3Z1P8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
4930467E23RikD3Z1P8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930467E23RikD3Z1P8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930467E23RikD3Z1P8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930467E23RikD3Z1P8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930467E23RikD3Z1P8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930467E23RikD3Z1P8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930467E23RikD3Z1P8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930467E23RikD3Z1P8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930467E23RikD3Z1P8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930467E23RikD3Z1P8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930467E23RikD3Z1P8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms