Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm6685D3YYP3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm6685D3YYP3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm6685D3YYP3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm6685D3YYP3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm6685D3YYP3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm6685D3YYP3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm6685D3YYP3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm6685D3YYP3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm6685D3YYP3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm6685D3YYP3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm6685D3YYP3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm6685D3YYP3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm6685D3YYP3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm6685D3YYP3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm6685D3YYP3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm6685D3YYP3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm6685D3YYP3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm6685D3YYP3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm6685D3YYP3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm6685D3YYP3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm6685D3YYP3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm6685D3YYP3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm6685D3YYP3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm6685D3YYP3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm6685D3YYP3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm6685D3YYP3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm6685D3YYP3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm6685D3YYP3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm6685D3YYP3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm6685D3YYP3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm6685D3YYP3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm6685D3YYP3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm6685D3YYP3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm6685D3YYP3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm6685D3YYP3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm6685D3YYP3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm6685D3YYP3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm6685D3YYP3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm6685D3YYP3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm6685D3YYP3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm6685D3YYP3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6685D3YYP3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6685D3YYP3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6685D3YYP3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6685D3YYP3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6685D3YYP3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6685D3YYP3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6685D3YYP3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6685D3YYP3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6685D3YYP3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6685D3YYP3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6685D3YYP3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6685D3YYP3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm6685D3YYP3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm6685D3YYP3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm6685D3YYP3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm6685D3YYP3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm6685D3YYP3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm6685D3YYP3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm6685D3YYP3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm6685D3YYP3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm6685D3YYP3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm6685D3YYP3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm6685D3YYP3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm6685D3YYP3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm6685D3YYP3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm6685D3YYP3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm6685D3YYP3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6685D3YYP3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6685D3YYP3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6685D3YYP3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6685D3YYP3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6685D3YYP3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6685D3YYP3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm6685D3YYP3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm6685D3YYP3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm6685D3YYP3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm6685D3YYP3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm6685D3YYP3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm6685D3YYP3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm6685D3YYP3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm6685D3YYP3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm6685D3YYP3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm6685D3YYP3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm6685D3YYP3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm6685D3YYP3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm6685D3YYP3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm6685D3YYP3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm6685D3YYP3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm6685D3YYP3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm6685D3YYP3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm6685D3YYP3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm6685D3YYP3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm6685D3YYP3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm6685D3YYP3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm6685D3YYP3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm6685D3YYP3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm6685D3YYP3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm6685D3YYP3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms