Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3259D3YUK0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3259D3YUK0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3259D3YUK0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3259D3YUK0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3259D3YUK0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3259D3YUK0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3259D3YUK0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3259D3YUK0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3259D3YUK0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3259D3YUK0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3259D3YUK0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3259D3YUK0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3259D3YUK0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3259D3YUK0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3259D3YUK0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3259D3YUK0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3259D3YUK0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3259D3YUK0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3259D3YUK0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3259D3YUK0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3259D3YUK0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3259D3YUK0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3259D3YUK0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3259D3YUK0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3259D3YUK0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3259D3YUK0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3259D3YUK0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3259D3YUK0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3259D3YUK0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3259D3YUK0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3259D3YUK0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3259D3YUK0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3259D3YUK0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3259D3YUK0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3259D3YUK0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3259D3YUK0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3259D3YUK0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3259D3YUK0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3259D3YUK0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3259D3YUK0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm3259D3YUK0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm3259D3YUK0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm3259D3YUK0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm3259D3YUK0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm3259D3YUK0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3259D3YUK0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3259D3YUK0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3259D3YUK0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3259D3YUK0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3259D3YUK0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3259D3YUK0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3259D3YUK0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3259D3YUK0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3259D3YUK0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3259D3YUK0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3259D3YUK0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3259D3YUK0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3259D3YUK0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3259D3YUK0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3259D3YUK0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3259D3YUK0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3259D3YUK0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3259D3YUK0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3259D3YUK0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3259D3YUK0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3259D3YUK0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3259D3YUK0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3259D3YUK0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3259D3YUK0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3259D3YUK0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3259D3YUK0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3259D3YUK0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3259D3YUK0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3259D3YUK0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3259D3YUK0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3259D3YUK0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3259D3YUK0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm3259D3YUK0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm3259D3YUK0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3259D3YUK0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3259D3YUK0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3259D3YUK0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3259D3YUK0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3259D3YUK0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3259D3YUK0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3259D3YUK0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3259D3YUK0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3259D3YUK0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3259D3YUK0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3259D3YUK0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3259D3YUK0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gm3259D3YUK0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm3259D3YUK0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3259D3YUK0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3259D3YUK0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3259D3YUK0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3259D3YUK0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3259D3YUK0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm3259D3YUK0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms