Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Cttnbp2B9EJA2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Cttnbp2B9EJA2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Cttnbp2B9EJA2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Cttnbp2B9EJA2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Cttnbp2B9EJA2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Cttnbp2B9EJA2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
Cttnbp2B9EJA2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Cttnbp2B9EJA2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Cttnbp2B9EJA2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
Cttnbp2B9EJA2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Cttnbp2B9EJA2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Cttnbp2B9EJA2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Cttnbp2B9EJA2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
Cttnbp2B9EJA2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Cttnbp2B9EJA2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
Cttnbp2B9EJA2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Cttnbp2B9EJA2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Cttnbp2B9EJA2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Cttnbp2B9EJA2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC38.83■■■■□ 3.81
Cttnbp2B9EJA2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Cttnbp2B9EJA2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
Cttnbp2B9EJA2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Cttnbp2B9EJA2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
Cttnbp2B9EJA2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
Cttnbp2B9EJA2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.81
Cttnbp2B9EJA2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Cttnbp2B9EJA2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Cttnbp2B9EJA2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Cttnbp2B9EJA2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Cttnbp2B9EJA2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Cttnbp2B9EJA2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Cttnbp2B9EJA2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Cttnbp2B9EJA2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Cttnbp2B9EJA2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Cttnbp2B9EJA2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Cttnbp2B9EJA2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Cttnbp2B9EJA2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
Cttnbp2B9EJA2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Cttnbp2B9EJA2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Cttnbp2B9EJA2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
Cttnbp2B9EJA2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC38.75■■■■□ 3.79
Cttnbp2B9EJA2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
Cttnbp2B9EJA2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
Cttnbp2B9EJA2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Cttnbp2B9EJA2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
Cttnbp2B9EJA2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Cttnbp2B9EJA2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Cttnbp2B9EJA2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Cttnbp2B9EJA2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Cttnbp2B9EJA2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Cttnbp2B9EJA2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Cttnbp2B9EJA2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Cttnbp2B9EJA2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Cttnbp2B9EJA2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Cttnbp2B9EJA2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Cttnbp2B9EJA2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Cttnbp2B9EJA2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Cttnbp2B9EJA2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Cttnbp2B9EJA2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Cttnbp2B9EJA2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Cttnbp2B9EJA2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Cttnbp2B9EJA2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Cttnbp2B9EJA2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Cttnbp2B9EJA2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Cttnbp2B9EJA2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Cttnbp2B9EJA2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Cttnbp2B9EJA2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Cttnbp2B9EJA2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Cttnbp2B9EJA2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.78
Cttnbp2B9EJA2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
Cttnbp2B9EJA2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
Cttnbp2B9EJA2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC38.63■■■■□ 3.77
Cttnbp2B9EJA2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Cttnbp2B9EJA2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Cttnbp2B9EJA2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
Cttnbp2B9EJA2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
Cttnbp2B9EJA2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Cttnbp2B9EJA2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Cttnbp2B9EJA2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Cttnbp2B9EJA2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Cttnbp2B9EJA2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
Cttnbp2B9EJA2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Cttnbp2B9EJA2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Cttnbp2B9EJA2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
Cttnbp2B9EJA2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Cttnbp2B9EJA2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Cttnbp2B9EJA2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Cttnbp2B9EJA2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Cttnbp2B9EJA2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Cttnbp2B9EJA2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Cttnbp2B9EJA2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Cttnbp2B9EJA2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Cttnbp2B9EJA2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Cttnbp2B9EJA2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Cttnbp2B9EJA2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Cttnbp2B9EJA2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Cttnbp2B9EJA2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Cttnbp2B9EJA2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms