Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trappc11B2RXC1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trappc11B2RXC1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trappc11B2RXC1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trappc11B2RXC1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trappc11B2RXC1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trappc11B2RXC1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trappc11B2RXC1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trappc11B2RXC1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Trappc11B2RXC1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trappc11B2RXC1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Trappc11B2RXC1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trappc11B2RXC1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trappc11B2RXC1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trappc11B2RXC1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trappc11B2RXC1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trappc11B2RXC1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trappc11B2RXC1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc11B2RXC1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc11B2RXC1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc11B2RXC1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc11B2RXC1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc11B2RXC1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trappc11B2RXC1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trappc11B2RXC1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trappc11B2RXC1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Trappc11B2RXC1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trappc11B2RXC1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trappc11B2RXC1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trappc11B2RXC1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trappc11B2RXC1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trappc11B2RXC1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trappc11B2RXC1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trappc11B2RXC1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trappc11B2RXC1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trappc11B2RXC1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc11B2RXC1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc11B2RXC1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc11B2RXC1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc11B2RXC1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc11B2RXC1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trappc11B2RXC1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trappc11B2RXC1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trappc11B2RXC1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trappc11B2RXC1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trappc11B2RXC1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trappc11B2RXC1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trappc11B2RXC1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trappc11B2RXC1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trappc11B2RXC1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trappc11B2RXC1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc11B2RXC1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc11B2RXC1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc11B2RXC1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc11B2RXC1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc11B2RXC1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc11B2RXC1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc11B2RXC1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc11B2RXC1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trappc11B2RXC1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trappc11B2RXC1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trappc11B2RXC1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trappc11B2RXC1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trappc11B2RXC1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trappc11B2RXC1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trappc11B2RXC1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trappc11B2RXC1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trappc11B2RXC1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trappc11B2RXC1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Trappc11B2RXC1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Trappc11B2RXC1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trappc11B2RXC1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trappc11B2RXC1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trappc11B2RXC1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trappc11B2RXC1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trappc11B2RXC1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trappc11B2RXC1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trappc11B2RXC1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trappc11B2RXC1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trappc11B2RXC1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trappc11B2RXC1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trappc11B2RXC1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc11B2RXC1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc11B2RXC1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc11B2RXC1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc11B2RXC1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc11B2RXC1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc11B2RXC1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trappc11B2RXC1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trappc11B2RXC1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc11B2RXC1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc11B2RXC1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc11B2RXC1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trappc11B2RXC1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc11B2RXC1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc11B2RXC1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc11B2RXC1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc11B2RXC1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trappc11B2RXC1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc11B2RXC1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms