Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cspp1B2RX88 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cspp1B2RX88 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cspp1B2RX88 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cspp1B2RX88 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cspp1B2RX88 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cspp1B2RX88 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cspp1B2RX88 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cspp1B2RX88 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cspp1B2RX88 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cspp1B2RX88 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cspp1B2RX88 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cspp1B2RX88 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cspp1B2RX88 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cspp1B2RX88 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cspp1B2RX88 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cspp1B2RX88 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cspp1B2RX88 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cspp1B2RX88 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cspp1B2RX88 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cspp1B2RX88 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Cspp1B2RX88 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cspp1B2RX88 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cspp1B2RX88 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cspp1B2RX88 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cspp1B2RX88 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cspp1B2RX88 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cspp1B2RX88 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cspp1B2RX88 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cspp1B2RX88 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cspp1B2RX88 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cspp1B2RX88 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cspp1B2RX88 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cspp1B2RX88 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cspp1B2RX88 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cspp1B2RX88 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Cspp1B2RX88 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cspp1B2RX88 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cspp1B2RX88 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cspp1B2RX88 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cspp1B2RX88 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cspp1B2RX88 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cspp1B2RX88 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cspp1B2RX88 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cspp1B2RX88 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cspp1B2RX88 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cspp1B2RX88 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cspp1B2RX88 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cspp1B2RX88 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cspp1B2RX88 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cspp1B2RX88 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cspp1B2RX88 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Cspp1B2RX88 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cspp1B2RX88 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cspp1B2RX88 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cspp1B2RX88 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cspp1B2RX88 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cspp1B2RX88 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cspp1B2RX88 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cspp1B2RX88 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cspp1B2RX88 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cspp1B2RX88 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Cspp1B2RX88 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Cspp1B2RX88 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cspp1B2RX88 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cspp1B2RX88 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cspp1B2RX88 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cspp1B2RX88 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cspp1B2RX88 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cspp1B2RX88 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cspp1B2RX88 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cspp1B2RX88 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cspp1B2RX88 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cspp1B2RX88 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cspp1B2RX88 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cspp1B2RX88 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cspp1B2RX88 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cspp1B2RX88 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cspp1B2RX88 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cspp1B2RX88 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cspp1B2RX88 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cspp1B2RX88 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cspp1B2RX88 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cspp1B2RX88 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cspp1B2RX88 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cspp1B2RX88 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cspp1B2RX88 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cspp1B2RX88 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cspp1B2RX88 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cspp1B2RX88 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Cspp1B2RX88 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cspp1B2RX88 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cspp1B2RX88 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cspp1B2RX88 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cspp1B2RX88 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cspp1B2RX88 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Cspp1B2RX88 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cspp1B2RX88 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cspp1B2RX88 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Cspp1B2RX88 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms