Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Siah3B2RWG3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Siah3B2RWG3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Siah3B2RWG3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Siah3B2RWG3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Siah3B2RWG3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Siah3B2RWG3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Siah3B2RWG3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Siah3B2RWG3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Siah3B2RWG3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Siah3B2RWG3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Siah3B2RWG3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Siah3B2RWG3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Siah3B2RWG3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Siah3B2RWG3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Siah3B2RWG3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Siah3B2RWG3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Siah3B2RWG3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Siah3B2RWG3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Siah3B2RWG3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Siah3B2RWG3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Siah3B2RWG3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Siah3B2RWG3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Siah3B2RWG3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Siah3B2RWG3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Siah3B2RWG3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Siah3B2RWG3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Siah3B2RWG3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Siah3B2RWG3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Siah3B2RWG3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Siah3B2RWG3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Siah3B2RWG3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Siah3B2RWG3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Siah3B2RWG3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Siah3B2RWG3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Siah3B2RWG3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Siah3B2RWG3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Siah3B2RWG3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Siah3B2RWG3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Siah3B2RWG3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Siah3B2RWG3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Siah3B2RWG3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Siah3B2RWG3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Siah3B2RWG3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Siah3B2RWG3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Siah3B2RWG3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Siah3B2RWG3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Siah3B2RWG3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Siah3B2RWG3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Siah3B2RWG3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Siah3B2RWG3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Siah3B2RWG3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Siah3B2RWG3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Siah3B2RWG3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Siah3B2RWG3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Siah3B2RWG3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Siah3B2RWG3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Siah3B2RWG3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Siah3B2RWG3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Siah3B2RWG3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Siah3B2RWG3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Siah3B2RWG3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Siah3B2RWG3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Siah3B2RWG3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Siah3B2RWG3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Siah3B2RWG3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Siah3B2RWG3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Siah3B2RWG3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Siah3B2RWG3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Siah3B2RWG3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Siah3B2RWG3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Siah3B2RWG3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Siah3B2RWG3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Siah3B2RWG3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Siah3B2RWG3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Siah3B2RWG3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Siah3B2RWG3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Siah3B2RWG3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Siah3B2RWG3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Siah3B2RWG3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Siah3B2RWG3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Siah3B2RWG3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Siah3B2RWG3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Siah3B2RWG3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Siah3B2RWG3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Siah3B2RWG3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Siah3B2RWG3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Siah3B2RWG3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Siah3B2RWG3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Siah3B2RWG3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Siah3B2RWG3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Siah3B2RWG3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Siah3B2RWG3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Siah3B2RWG3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Siah3B2RWG3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Siah3B2RWG3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Siah3B2RWG3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Siah3B2RWG3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Siah3B2RWG3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Siah3B2RWG3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms