Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clrn2B2RVW2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clrn2B2RVW2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clrn2B2RVW2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clrn2B2RVW2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clrn2B2RVW2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clrn2B2RVW2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clrn2B2RVW2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Clrn2B2RVW2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Clrn2B2RVW2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Clrn2B2RVW2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Clrn2B2RVW2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Clrn2B2RVW2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clrn2B2RVW2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clrn2B2RVW2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Clrn2B2RVW2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Clrn2B2RVW2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Clrn2B2RVW2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clrn2B2RVW2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clrn2B2RVW2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clrn2B2RVW2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clrn2B2RVW2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clrn2B2RVW2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clrn2B2RVW2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Clrn2B2RVW2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clrn2B2RVW2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clrn2B2RVW2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clrn2B2RVW2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clrn2B2RVW2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Clrn2B2RVW2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clrn2B2RVW2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clrn2B2RVW2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clrn2B2RVW2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clrn2B2RVW2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clrn2B2RVW2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clrn2B2RVW2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clrn2B2RVW2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clrn2B2RVW2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Clrn2B2RVW2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clrn2B2RVW2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clrn2B2RVW2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clrn2B2RVW2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clrn2B2RVW2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clrn2B2RVW2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clrn2B2RVW2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clrn2B2RVW2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clrn2B2RVW2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clrn2B2RVW2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clrn2B2RVW2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clrn2B2RVW2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clrn2B2RVW2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Clrn2B2RVW2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clrn2B2RVW2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clrn2B2RVW2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clrn2B2RVW2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clrn2B2RVW2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clrn2B2RVW2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clrn2B2RVW2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clrn2B2RVW2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clrn2B2RVW2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clrn2B2RVW2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clrn2B2RVW2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Clrn2B2RVW2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clrn2B2RVW2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clrn2B2RVW2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clrn2B2RVW2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clrn2B2RVW2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clrn2B2RVW2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clrn2B2RVW2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clrn2B2RVW2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clrn2B2RVW2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clrn2B2RVW2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clrn2B2RVW2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clrn2B2RVW2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clrn2B2RVW2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clrn2B2RVW2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clrn2B2RVW2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clrn2B2RVW2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clrn2B2RVW2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clrn2B2RVW2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clrn2B2RVW2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clrn2B2RVW2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Clrn2B2RVW2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Clrn2B2RVW2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Clrn2B2RVW2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clrn2B2RVW2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clrn2B2RVW2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clrn2B2RVW2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clrn2B2RVW2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clrn2B2RVW2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clrn2B2RVW2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clrn2B2RVW2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clrn2B2RVW2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clrn2B2RVW2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Clrn2B2RVW2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clrn2B2RVW2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clrn2B2RVW2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clrn2B2RVW2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clrn2B2RVW2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Clrn2B2RVW2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms