Protein–RNA interactions for Protein: B2RT44

Lonrf2, LON peptidase N-terminal domain and ring finger 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf2B2RT44 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lonrf2B2RT44 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lonrf2B2RT44 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lonrf2B2RT44 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lonrf2B2RT44 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lonrf2B2RT44 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lonrf2B2RT44 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lonrf2B2RT44 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lonrf2B2RT44 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lonrf2B2RT44 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lonrf2B2RT44 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lonrf2B2RT44 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lonrf2B2RT44 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lonrf2B2RT44 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lonrf2B2RT44 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lonrf2B2RT44 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lonrf2B2RT44 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lonrf2B2RT44 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lonrf2B2RT44 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lonrf2B2RT44 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lonrf2B2RT44 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lonrf2B2RT44 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lonrf2B2RT44 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lonrf2B2RT44 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lonrf2B2RT44 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lonrf2B2RT44 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lonrf2B2RT44 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lonrf2B2RT44 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lonrf2B2RT44 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lonrf2B2RT44 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lonrf2B2RT44 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lonrf2B2RT44 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lonrf2B2RT44 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lonrf2B2RT44 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lonrf2B2RT44 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lonrf2B2RT44 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lonrf2B2RT44 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Lonrf2B2RT44 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lonrf2B2RT44 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lonrf2B2RT44 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lonrf2B2RT44 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lonrf2B2RT44 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lonrf2B2RT44 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lonrf2B2RT44 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lonrf2B2RT44 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lonrf2B2RT44 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lonrf2B2RT44 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lonrf2B2RT44 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lonrf2B2RT44 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lonrf2B2RT44 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lonrf2B2RT44 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lonrf2B2RT44 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lonrf2B2RT44 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lonrf2B2RT44 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lonrf2B2RT44 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lonrf2B2RT44 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lonrf2B2RT44 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lonrf2B2RT44 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lonrf2B2RT44 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lonrf2B2RT44 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lonrf2B2RT44 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lonrf2B2RT44 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lonrf2B2RT44 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lonrf2B2RT44 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lonrf2B2RT44 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lonrf2B2RT44 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lonrf2B2RT44 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lonrf2B2RT44 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lonrf2B2RT44 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lonrf2B2RT44 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lonrf2B2RT44 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lonrf2B2RT44 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lonrf2B2RT44 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lonrf2B2RT44 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lonrf2B2RT44 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lonrf2B2RT44 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lonrf2B2RT44 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lonrf2B2RT44 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lonrf2B2RT44 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lonrf2B2RT44 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lonrf2B2RT44 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lonrf2B2RT44 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lonrf2B2RT44 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lonrf2B2RT44 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lonrf2B2RT44 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lonrf2B2RT44 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lonrf2B2RT44 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lonrf2B2RT44 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lonrf2B2RT44 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lonrf2B2RT44 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lonrf2B2RT44 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lonrf2B2RT44 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lonrf2B2RT44 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lonrf2B2RT44 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lonrf2B2RT44 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lonrf2B2RT44 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lonrf2B2RT44 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lonrf2B2RT44 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lonrf2B2RT44 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lonrf2B2RT44 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms