Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1B2KF50 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1B2KF50 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1B2KF50 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1B2KF50 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1B2KF50 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1B2KF50 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1B2KF50 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1B2KF50 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1B2KF50 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1B2KF50 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1B2KF50 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1B2KF50 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1B2KF50 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1B2KF50 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1B2KF50 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1B2KF50 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1B2KF50 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1B2KF50 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1B2KF50 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Uhrf1bp1B2KF50 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1B2KF50 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1B2KF50 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1B2KF50 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1B2KF50 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1B2KF50 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1B2KF50 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1B2KF50 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1B2KF50 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1B2KF50 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1B2KF50 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1B2KF50 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1B2KF50 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1B2KF50 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1B2KF50 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1B2KF50 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1B2KF50 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1B2KF50 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1B2KF50 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Uhrf1bp1B2KF50 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1B2KF50 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1B2KF50 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1B2KF50 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1B2KF50 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1B2KF50 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1B2KF50 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1B2KF50 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1B2KF50 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1B2KF50 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1B2KF50 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1B2KF50 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1B2KF50 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1B2KF50 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1B2KF50 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1B2KF50 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1B2KF50 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1B2KF50 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1B2KF50 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1B2KF50 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1B2KF50 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1B2KF50 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1B2KF50 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1B2KF50 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1B2KF50 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1B2KF50 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1B2KF50 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1B2KF50 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1B2KF50 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1B2KF50 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1B2KF50 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1B2KF50 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1B2KF50 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1B2KF50 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1B2KF50 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1B2KF50 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1B2KF50 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1B2KF50 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1B2KF50 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1B2KF50 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1B2KF50 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1B2KF50 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Uhrf1bp1B2KF50 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1B2KF50 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms