Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col4a6B1AVK5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col4a6B1AVK5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col4a6B1AVK5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col4a6B1AVK5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col4a6B1AVK5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col4a6B1AVK5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col4a6B1AVK5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col4a6B1AVK5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col4a6B1AVK5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col4a6B1AVK5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col4a6B1AVK5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col4a6B1AVK5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col4a6B1AVK5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a6B1AVK5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a6B1AVK5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a6B1AVK5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a6B1AVK5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a6B1AVK5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a6B1AVK5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col4a6B1AVK5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col4a6B1AVK5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Col4a6B1AVK5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col4a6B1AVK5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col4a6B1AVK5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col4a6B1AVK5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col4a6B1AVK5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col4a6B1AVK5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col4a6B1AVK5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col4a6B1AVK5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col4a6B1AVK5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col4a6B1AVK5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col4a6B1AVK5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Col4a6B1AVK5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Col4a6B1AVK5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col4a6B1AVK5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col4a6B1AVK5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col4a6B1AVK5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col4a6B1AVK5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col4a6B1AVK5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col4a6B1AVK5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col4a6B1AVK5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col4a6B1AVK5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col4a6B1AVK5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col4a6B1AVK5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col4a6B1AVK5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col4a6B1AVK5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col4a6B1AVK5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Col4a6B1AVK5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Col4a6B1AVK5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Col4a6B1AVK5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Col4a6B1AVK5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col4a6B1AVK5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col4a6B1AVK5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col4a6B1AVK5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col4a6B1AVK5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col4a6B1AVK5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col4a6B1AVK5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col4a6B1AVK5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col4a6B1AVK5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col4a6B1AVK5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col4a6B1AVK5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col4a6B1AVK5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col4a6B1AVK5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col4a6B1AVK5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col4a6B1AVK5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col4a6B1AVK5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col4a6B1AVK5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col4a6B1AVK5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col4a6B1AVK5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col4a6B1AVK5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col4a6B1AVK5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col4a6B1AVK5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col4a6B1AVK5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col4a6B1AVK5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col4a6B1AVK5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col4a6B1AVK5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col4a6B1AVK5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col4a6B1AVK5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col4a6B1AVK5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col4a6B1AVK5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col4a6B1AVK5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col4a6B1AVK5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col4a6B1AVK5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col4a6B1AVK5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a6B1AVK5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a6B1AVK5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a6B1AVK5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a6B1AVK5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a6B1AVK5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a6B1AVK5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a6B1AVK5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col4a6B1AVK5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col4a6B1AVK5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col4a6B1AVK5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col4a6B1AVK5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col4a6B1AVK5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a6B1AVK5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a6B1AVK5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a6B1AVK5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms