Protein–RNA interactions for Protein: B1AQP7

Apol7b, Apolipoprotein L 7b, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7bB1AQP7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apol7bB1AQP7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apol7bB1AQP7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Apol7bB1AQP7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apol7bB1AQP7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apol7bB1AQP7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Apol7bB1AQP7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Apol7bB1AQP7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Apol7bB1AQP7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apol7bB1AQP7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apol7bB1AQP7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apol7bB1AQP7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apol7bB1AQP7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apol7bB1AQP7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apol7bB1AQP7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apol7bB1AQP7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Apol7bB1AQP7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apol7bB1AQP7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apol7bB1AQP7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apol7bB1AQP7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apol7bB1AQP7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apol7bB1AQP7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apol7bB1AQP7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apol7bB1AQP7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apol7bB1AQP7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apol7bB1AQP7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apol7bB1AQP7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apol7bB1AQP7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apol7bB1AQP7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Apol7bB1AQP7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apol7bB1AQP7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apol7bB1AQP7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apol7bB1AQP7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apol7bB1AQP7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apol7bB1AQP7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apol7bB1AQP7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apol7bB1AQP7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apol7bB1AQP7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apol7bB1AQP7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apol7bB1AQP7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apol7bB1AQP7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apol7bB1AQP7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apol7bB1AQP7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apol7bB1AQP7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apol7bB1AQP7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apol7bB1AQP7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apol7bB1AQP7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Apol7bB1AQP7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apol7bB1AQP7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apol7bB1AQP7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apol7bB1AQP7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apol7bB1AQP7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Apol7bB1AQP7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apol7bB1AQP7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apol7bB1AQP7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apol7bB1AQP7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apol7bB1AQP7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apol7bB1AQP7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apol7bB1AQP7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apol7bB1AQP7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apol7bB1AQP7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apol7bB1AQP7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apol7bB1AQP7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apol7bB1AQP7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Apol7bB1AQP7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apol7bB1AQP7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apol7bB1AQP7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apol7bB1AQP7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apol7bB1AQP7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apol7bB1AQP7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apol7bB1AQP7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apol7bB1AQP7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apol7bB1AQP7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apol7bB1AQP7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apol7bB1AQP7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apol7bB1AQP7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Apol7bB1AQP7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apol7bB1AQP7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Apol7bB1AQP7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Apol7bB1AQP7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Apol7bB1AQP7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apol7bB1AQP7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apol7bB1AQP7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apol7bB1AQP7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apol7bB1AQP7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apol7bB1AQP7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apol7bB1AQP7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apol7bB1AQP7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apol7bB1AQP7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apol7bB1AQP7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apol7bB1AQP7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apol7bB1AQP7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apol7bB1AQP7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apol7bB1AQP7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apol7bB1AQP7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apol7bB1AQP7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apol7bB1AQP7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apol7bB1AQP7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apol7bB1AQP7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apol7bB1AQP7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms