Protein–RNA interactions for Protein: A9Q751

Cfap221, Cilia- and flagella-associated protein 221, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap221A9Q751 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cfap221A9Q751 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cfap221A9Q751 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cfap221A9Q751 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cfap221A9Q751 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cfap221A9Q751 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cfap221A9Q751 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cfap221A9Q751 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cfap221A9Q751 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cfap221A9Q751 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cfap221A9Q751 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cfap221A9Q751 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cfap221A9Q751 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cfap221A9Q751 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cfap221A9Q751 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfap221A9Q751 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfap221A9Q751 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfap221A9Q751 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfap221A9Q751 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfap221A9Q751 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfap221A9Q751 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfap221A9Q751 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cfap221A9Q751 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap221A9Q751 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap221A9Q751 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap221A9Q751 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap221A9Q751 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap221A9Q751 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cfap221A9Q751 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cfap221A9Q751 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cfap221A9Q751 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cfap221A9Q751 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cfap221A9Q751 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cfap221A9Q751 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cfap221A9Q751 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cfap221A9Q751 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cfap221A9Q751 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfap221A9Q751 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cfap221A9Q751 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cfap221A9Q751 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cfap221A9Q751 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cfap221A9Q751 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cfap221A9Q751 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cfap221A9Q751 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfap221A9Q751 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfap221A9Q751 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfap221A9Q751 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfap221A9Q751 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfap221A9Q751 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfap221A9Q751 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfap221A9Q751 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cfap221A9Q751 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cfap221A9Q751 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cfap221A9Q751 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cfap221A9Q751 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cfap221A9Q751 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cfap221A9Q751 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms