Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn1aA2APX8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scn1aA2APX8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn1aA2APX8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn1aA2APX8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scn1aA2APX8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scn1aA2APX8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Scn1aA2APX8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn1aA2APX8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn1aA2APX8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn1aA2APX8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn1aA2APX8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scn1aA2APX8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn1aA2APX8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn1aA2APX8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn1aA2APX8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn1aA2APX8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scn1aA2APX8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scn1aA2APX8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scn1aA2APX8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scn1aA2APX8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scn1aA2APX8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scn1aA2APX8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scn1aA2APX8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scn1aA2APX8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scn1aA2APX8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn1aA2APX8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn1aA2APX8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn1aA2APX8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn1aA2APX8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scn1aA2APX8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn1aA2APX8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn1aA2APX8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn1aA2APX8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn1aA2APX8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn1aA2APX8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn1aA2APX8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scn1aA2APX8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn1aA2APX8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn1aA2APX8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn1aA2APX8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn1aA2APX8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scn1aA2APX8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn1aA2APX8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn1aA2APX8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn1aA2APX8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn1aA2APX8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn1aA2APX8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn1aA2APX8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn1aA2APX8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scn1aA2APX8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn1aA2APX8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn1aA2APX8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn1aA2APX8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn1aA2APX8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn1aA2APX8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn1aA2APX8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn1aA2APX8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scn1aA2APX8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn1aA2APX8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn1aA2APX8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn1aA2APX8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn1aA2APX8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn1aA2APX8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn1aA2APX8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scn1aA2APX8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn1aA2APX8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn1aA2APX8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scn1aA2APX8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Scn1aA2APX8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Scn1aA2APX8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Scn1aA2APX8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Scn1aA2APX8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn1aA2APX8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn1aA2APX8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn1aA2APX8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn1aA2APX8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scn1aA2APX8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn1aA2APX8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn1aA2APX8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn1aA2APX8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn1aA2APX8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn1aA2APX8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scn1aA2APX8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn1aA2APX8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn1aA2APX8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn1aA2APX8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn1aA2APX8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn1aA2APX8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn1aA2APX8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn1aA2APX8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn1aA2APX8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn1aA2APX8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scn1aA2APX8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scn1aA2APX8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scn1aA2APX8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scn1aA2APX8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scn1aA2APX8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scn1aA2APX8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scn1aA2APX8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms