Protein–RNA interactions for Protein: A2ALV5

AI481877, Expressed sequence AI481877, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AI481877A2ALV5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
AI481877A2ALV5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
AI481877A2ALV5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
AI481877A2ALV5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
AI481877A2ALV5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
AI481877A2ALV5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
AI481877A2ALV5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
AI481877A2ALV5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
AI481877A2ALV5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
AI481877A2ALV5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
AI481877A2ALV5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
AI481877A2ALV5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
AI481877A2ALV5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
AI481877A2ALV5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
AI481877A2ALV5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
AI481877A2ALV5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
AI481877A2ALV5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
AI481877A2ALV5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
AI481877A2ALV5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
AI481877A2ALV5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
AI481877A2ALV5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
AI481877A2ALV5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
AI481877A2ALV5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
AI481877A2ALV5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
AI481877A2ALV5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
AI481877A2ALV5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
AI481877A2ALV5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
AI481877A2ALV5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
AI481877A2ALV5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
AI481877A2ALV5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
AI481877A2ALV5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
AI481877A2ALV5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
AI481877A2ALV5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
AI481877A2ALV5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
AI481877A2ALV5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
AI481877A2ALV5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
AI481877A2ALV5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
AI481877A2ALV5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
AI481877A2ALV5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
AI481877A2ALV5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
AI481877A2ALV5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
AI481877A2ALV5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
AI481877A2ALV5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
AI481877A2ALV5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
AI481877A2ALV5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
AI481877A2ALV5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
AI481877A2ALV5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
AI481877A2ALV5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
AI481877A2ALV5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
AI481877A2ALV5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
AI481877A2ALV5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
AI481877A2ALV5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
AI481877A2ALV5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
AI481877A2ALV5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
AI481877A2ALV5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
AI481877A2ALV5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
AI481877A2ALV5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
AI481877A2ALV5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
AI481877A2ALV5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
AI481877A2ALV5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
AI481877A2ALV5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
AI481877A2ALV5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
AI481877A2ALV5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
AI481877A2ALV5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
AI481877A2ALV5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
AI481877A2ALV5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
AI481877A2ALV5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
AI481877A2ALV5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
AI481877A2ALV5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
AI481877A2ALV5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
AI481877A2ALV5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
AI481877A2ALV5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
AI481877A2ALV5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
AI481877A2ALV5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
AI481877A2ALV5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
AI481877A2ALV5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
AI481877A2ALV5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
AI481877A2ALV5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
AI481877A2ALV5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
AI481877A2ALV5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
AI481877A2ALV5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
AI481877A2ALV5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
AI481877A2ALV5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
AI481877A2ALV5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
AI481877A2ALV5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
AI481877A2ALV5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
AI481877A2ALV5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
AI481877A2ALV5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
AI481877A2ALV5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
AI481877A2ALV5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
AI481877A2ALV5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
AI481877A2ALV5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
AI481877A2ALV5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
AI481877A2ALV5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
AI481877A2ALV5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
AI481877A2ALV5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
AI481877A2ALV5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
AI481877A2ALV5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
AI481877A2ALV5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
AI481877A2ALV5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms