Protein–RNA interactions for Protein: A2A899

Gm13090, Predicted gene 13090, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13090A2A899 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm13090A2A899 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm13090A2A899 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm13090A2A899 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm13090A2A899 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm13090A2A899 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm13090A2A899 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm13090A2A899 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm13090A2A899 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm13090A2A899 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm13090A2A899 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm13090A2A899 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm13090A2A899 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm13090A2A899 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm13090A2A899 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm13090A2A899 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm13090A2A899 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm13090A2A899 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm13090A2A899 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm13090A2A899 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm13090A2A899 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm13090A2A899 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm13090A2A899 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm13090A2A899 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm13090A2A899 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm13090A2A899 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm13090A2A899 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm13090A2A899 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm13090A2A899 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm13090A2A899 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm13090A2A899 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm13090A2A899 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm13090A2A899 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm13090A2A899 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm13090A2A899 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm13090A2A899 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm13090A2A899 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm13090A2A899 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm13090A2A899 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm13090A2A899 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm13090A2A899 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm13090A2A899 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm13090A2A899 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm13090A2A899 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm13090A2A899 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm13090A2A899 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm13090A2A899 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm13090A2A899 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm13090A2A899 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm13090A2A899 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm13090A2A899 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm13090A2A899 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm13090A2A899 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm13090A2A899 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm13090A2A899 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm13090A2A899 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm13090A2A899 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm13090A2A899 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm13090A2A899 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm13090A2A899 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm13090A2A899 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm13090A2A899 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm13090A2A899 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm13090A2A899 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm13090A2A899 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm13090A2A899 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm13090A2A899 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm13090A2A899 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm13090A2A899 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm13090A2A899 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm13090A2A899 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm13090A2A899 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm13090A2A899 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm13090A2A899 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm13090A2A899 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm13090A2A899 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm13090A2A899 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm13090A2A899 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm13090A2A899 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm13090A2A899 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm13090A2A899 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm13090A2A899 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm13090A2A899 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm13090A2A899 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm13090A2A899 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm13090A2A899 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm13090A2A899 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm13090A2A899 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm13090A2A899 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm13090A2A899 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm13090A2A899 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm13090A2A899 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm13090A2A899 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm13090A2A899 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm13090A2A899 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm13090A2A899 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm13090A2A899 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm13090A2A899 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm13090A2A899 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm13090A2A899 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1624.9 ms